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1. (WO2019047083) PROCÉDÉ ET DISPOSITIF POUR DÉTERMINER UN ENSEMBLE DE LOCI SNP ET APPLICATIONS ASSOCIÉES
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N° de publication : WO/2019/047083 N° de la demande internationale : PCT/CN2017/100786
Date de publication : 14.03.2019 Date de dépôt international : 06.09.2017
CIB :
C12Q 1/68 (2018.01)
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
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BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
Q
PROCÉDÉS DE MESURE, DE RECHERCHE OU D'ANALYSE FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
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Procédés de mesure, de recherche ou d'analyse faisant intervenir des enzymes ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
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faisant intervenir des acides nucléiques
Déposants :
深圳华大生命科学研究院 BGI SHENZHEN [CN/CN]; 中国广东省深圳市 盐田区北山工业区综合楼 Main Building, Beishan Industrial Zone, Yantian District Shenzhen, Guangdong 518083, CN
Inventeurs :
郭瑞东 GUO, Ruidong; CN
贾超 JIA, Chao; CN
Mandataire :
北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) TSINGYIHUA INTELLECTUAL PROPERTY LLC; 中国北京市 海淀区清华园清华大学照澜院商业楼301室 Room 301 Trade Building, Zhaolanyuan, Tsinghua University Qinghuayuan, Haidian District Beijing 100084, CN
Données relatives à la priorité :
Titre (EN) METHOD AND DEVICE FOR DETERMINING SNP LOCI SET AND APPLICATIONS THEREOF
(FR) PROCÉDÉ ET DISPOSITIF POUR DÉTERMINER UN ENSEMBLE DE LOCI SNP ET APPLICATIONS ASSOCIÉES
(ZH) 确定SNP位点集合的方法、装置及其应用
Abrégé :
(EN) Provided is a method for determining a SNP loci set. The SNP loci set is for use in pedigree verification of a predetermined breed of a predetermined species. The method comprises: (1) constructing a first SNP loci set and a second SNP loci set, every SNP locus of the first SNP loci set being sourced from a biological body of the predetermined species, every SNP locus of the second SNP loci set being sourced from the biological body of the predetermined species; (2) with respect to every SNP locus of the first SNP loci set, respectively determining the species occurrence frequency of a predetermined base type in the predetermined species; (3) with respect to every SNP locus of the second SNP loci set, respectively determining the breed occurrence frequency of the predetermined base type in the predetermined breed; and (4) determining a SNP loci set for use in pedigree verification of the predetermined breed on the basis of the difference between the breed occurrence frequency and the species occurrence frequency.
(FR) L'invention concerne un procédé pour déterminer un ensemble de loci SNP. L'ensemble de loci SNP est destiné à être utilisé dans une vérification d'origine d'une race prédéfinie d'une espèce prédéfinie. Le procédé consiste à : (1) construire un premier ensemble de loci SNP et un second ensemble de loci SNP, chaque locus SNP du premier ensemble de loci SNP étant issu d'un corps biologique de l'espèce prédéfinie, chaque locus SNP du second ensemble de loci SNP étant issu du corps biologique de l'espèce prédéfinie ; (2) par rapport à chaque locus SNP du premier ensemble de loci SNP, déterminer respectivement la fréquence d'occurrence d'espèce d'un type de base prédéfini dans l'espèce prédéfinie ; (3) par rapport à chaque locus SNP du second ensemble de loci SNP, déterminer respectivement la fréquence d'occurrence de race du type de base prédéfini dans la race prédéfinie ; et (4) déterminer un ensemble de loci SNP destiné à être utilisé dans la vérification d'origine de la race prédéfinie sur la base de la différence entre la fréquence d'occurrence de race et la fréquence d'occurrence d'espèce.
(ZH) 提供了一种确定SNP位点集合的方法。其中,该SNP位点集合用于预定物种的预定品种的纯种鉴定,该方法包括:(1)构建第一SNP位点集合和第二SNP位点集合,该第一SNP位点集合中的每一个SNP位点均来源于该预定物种的生物体,该第二SNP位点集合中的每一个SNP位点均来源于该预定品种的生物体;(2)针对该第一SNP位点集合中的每一个SNP位点,分别确定预定碱基类型在该预定物种中的物种出现频率;(3)针对该第二SNP位点集合中的每一个SNP位点,分别确定预定碱基类型在该预定品种中的品种出现频率;(4)基于该品种出现频率与该物种出现频率的差异,确定用于该预定品种的纯种鉴定的SNP位点集合。
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
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Langue de publication : chinois (ZH)
Langue de dépôt : chinois (ZH)