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1. (WO2019032760) PROCÉDÉ AMÉLIORÉ D'ANALYSE DE TENEURS EN ACIDE NUCLÉIQUE À PARTIR DE PARTICULES BIOLOGIQUES MULTIPLES
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N° de publication : WO/2019/032760 N° de la demande internationale : PCT/US2018/045891
Date de publication : 14.02.2019 Date de dépôt international : 09.08.2018
CIB :
C12Q 1/6806 (2018.01) ,C12Q 1/6869 (2018.01)
[IPC code unknown for C12Q 1/6806][IPC code unknown for C12Q 1/6869]
Déposants :
ROOTPATH GENOMICS, INC. [US/US]; 43 Charles Street, Suite 2 Boston, Massachusetts 02114, US
Inventeurs :
PORTER, Ely; US
CHEN, Xi; US
Mandataire :
SCHOENHARD, Amy E.L.; US
MCNEILL, Rebecca M.; US
BAUR, Amelia F.; US
SCARR, Rebecca B.; US
HENNINGER, Mary R.; US
DOHERTY, Elizabeth A.; US
BREIER, Adam M.; US
HERZFELD, Deborah M.; US
PRYBYLOWSKI, Kate; US
LEE, Victoria; US
RACHINSKY, Tara; US
CHO, Hojung; US
Données relatives à la priorité :
62/543,57910.08.2017US
Titre (EN) IMPROVED METHOD TO ANALYZE NUCLEIC ACID CONTENTS FROM MULTIPLE BIOLOGICAL PARTICLES
(FR) PROCÉDÉ AMÉLIORÉ D'ANALYSE DE TENEURS EN ACIDE NUCLÉIQUE À PARTIR DE PARTICULES BIOLOGIQUES MULTIPLES
Abrégé :
(EN) The application provides improved methods of analyzing biological particles and their constituents, including methods of labeling at least one target nucleic acid molecule from a biological particle with a barcoded primer. The method is based on compartments (droplets) with cells and beads carrying the barcoded primers. The compartments are broken and the content contacted with polymerase, e.g. reverse transcriptase. The method is characterised in that it contains a step of inactivating the primers on the beads, which have not reacted with target, using oligos having sequences complementary to the beads; in that it contains steps for fixation reversal of fixed cells; or in that the barcoded primers are pooled after the primers have been mobilised from the beads.
(FR) La demande concerne des procédés améliorés d'analyse de particules biologiques et de leurs constituants, notamment des procédés de marquage d'au moins une molécule d'acide nucléique cible à partir d'une particule biologique avec une amorce à code à barres. Le procédé repose sur des compartiments (gouttelettes) avec des cellules et des billes portant les amorces à code à barres. Les compartiments sont brisés et le contenu est mis en contact avec une polymérase, par exemple la transcriptase inverse. Le procédé est caractérisé en ce qu'il comprend une étape consistant à inactiver les amorces sur les billes, qui n'ont pas réagi avec la cible, à l'aide d'oligos ayant des séquences complémentaires des billes; en ce qu'il comprend des étapes d'inversion de fixation des cellules fixées; ou en ce que les amorces à code à barres sont combinées après que les amorces ont été mobilisées à partir des billes.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)