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1. (WO2018204262) FACTEURS DE TRANSCRIPTION RÉGULANT LA DIFFÉRENCIATION DE CELLULES SOUCHES
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N° de publication : WO/2018/204262 N° de la demande internationale : PCT/US2018/030216
Date de publication : 08.11.2018 Date de dépôt international : 30.04.2018
CIB :
C12N 5/071 (2010.01) ,C12N 5/0735 (2010.01) ,C12N 5/0797 (2010.01)
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
12
BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
N
MICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
5
Cellules non différenciées humaines, animales ou végétales, p.ex. lignées cellulaires; Tissus; Leur culture ou conservation; Milieux de culture à cet effet
07
Cellules animales ou tissus animaux
071
Cellules ou tissus de vertébrés, p.ex. cellules humaines ou tissus humains
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
12
BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
N
MICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
5
Cellules non différenciées humaines, animales ou végétales, p.ex. lignées cellulaires; Tissus; Leur culture ou conservation; Milieux de culture à cet effet
07
Cellules animales ou tissus animaux
071
Cellules ou tissus de vertébrés, p.ex. cellules humaines ou tissus humains
073
Cellules ou tissus embryonnaires; Cellules fœtales ou tissus fœtaux
0735
Cellules souches embryonnaires; Cellules germinales embryonnaires
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
12
BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
N
MICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
5
Cellules non différenciées humaines, animales ou végétales, p.ex. lignées cellulaires; Tissus; Leur culture ou conservation; Milieux de culture à cet effet
07
Cellules animales ou tissus animaux
071
Cellules ou tissus de vertébrés, p.ex. cellules humaines ou tissus humains
079
Cellules neurales
0797
Cellules souches; Cellules progénitrices
Déposants :
PRESIDENT AND FELLOWS OF HARVARD COLLEGE [US/US]; 17 Quincy Street Cambridge, Massachusetts 02138, US
Inventeurs :
NG, Alex H.M.; US
CHURCH, George M.; US
BUSSKAMP, Volker; DE
Mandataire :
IWANICKI, John P.; US
Données relatives à la priorité :
62/492,55201.05.2017US
62/517,30709.06.2017US
Titre (EN) TRANSCRIPTION FACTORS CONTROLLING DIFFERENTIATION OF STEM CELLS
(FR) FACTEURS DE TRANSCRIPTION RÉGULANT LA DIFFÉRENCIATION DE CELLULES SOUCHES
Abrégé :
(EN) Forced expression of a handful of transcription factors (TFs) can induce conversions between cell identities; however, the extent to which TFs can alter cell identity has not been systematically assessed. Here, we assembled a "human TFome," a comprehensive expression library of 1,578 human TF clones with full coverage of the major TF families. By systematically screening the human TFome, we identified many individual TFs that induce loss of human-induced-pluripotent-stem-cell (hiPSC) identity, suggesting a pervasive ability for TFs to alter cell identity. Using large-scale computational cell type classification trained on thousands of tissue expression profiles, we identified cell types generated by these TFs with high efficiency and speed, without additional selections or mechanical perturbations. TF expression in adult human tissues only correlated with some of the cell lineage generated, suggesting more complexity than observation studies can explain.
(FR) L'expression forcée d'un groupe de facteurs de transcription (TF) peut induire des conversions entre des identités cellulaires ; cependant, la mesure dans laquelle des TF peuvent modifier l'identité cellulaire n'a pas été systématiquement évaluée. Dans la présente invention, un "TFome humain" a été assemblé, qui est une banque d'expression complète de 1 578 clones de TF humains couvrant l'ensemble des principales familles de TF. Par le biais d'un criblage systématique du TFome humain, de nombreux TF individuels induisant une perte d’identité de cellule souche pluripotente induite humaine (hiPSC)) ont été identifiés, suggérant une capacité omniprésente des TF à modifier l'identité cellulaire. À l'aide d'une classification de type cellulaire informatique à grande échelle réalisée sur des milliers de profils d'expression de tissus, nous avons identifié des types cellulaires générés par ces TF avec une efficacité et une vitesse élevées, sans sélections supplémentaires ni perturbations mécaniques. L'expression de TF dans des tissus humains adultes n'est corrélée qu'avec une partie de la lignée cellulaire générée, suggérant ainsi une complexité plus importante par comparaison avec ce qu'il est possible d'expliquer par le biais d'études d'observation.
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Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)