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1. (WO2018203084) ANALYSE D'APPRENTISSAGE AUTOMATIQUE DE MESURES DE NANOPORES

Pub. No.:    WO/2018/203084    International Application No.:    PCT/GB2018/051208
Publication Date: Fri Nov 09 00:59:59 CET 2018 International Filing Date: Sat May 05 01:59:59 CEST 2018
IPC: G06N 3/04
C12Q 1/6869
G01N 33/487
Applicants: OXFORD NANOPORE TECHNOLOGIES LIMITED
Inventors: MASSINGHAM, Timothy Lee
HARVEY, Joseph Edward
Title: ANALYSE D'APPRENTISSAGE AUTOMATIQUE DE MESURES DE NANOPORES
Abstract:
L'invention concerne une série de mesures prises sur un polymère pendant la translocation à travers un nanopore, analysé à l'aide d'une technique d'apprentissage automatique utilisant un réseau neuronal récurrent (RNN). Le RNN peut déduire des matrices de probabilité postérieure représentant chacune, par rapport à différentes séquences historiques respectives d'unités polymères correspondant à des mesures avant la mesure respective, des probabilités postérieures de plusieurs changements différents de la séquence historique respective d'unités polymères donnant lieu à une nouvelle séquence d'unités polymères. En variante, le RNN peut émettre en sortie des décisions sur l'identité d'unités polymères successives de la série d'unités polymères, les décisions étant renvoyées dans le réseau neuronal récurrent. L'analyse peut comprendre la réalisation de convolutions de groupes de mesures consécutives à l'aide d'un détecteur de caractéristiques entraîné tel qu'un réseau neuronal convolutionnel afin de déduire une série de vecteurs de caractéristiques, sur lesquels fonctionne le RNN.