Certains contenus de cette application ne sont pas disponibles pour le moment.
Si cette situation persiste, veuillez nous contacter àObservations et contact
1. (WO2018197374) COMPRESSION ET ANNOTATION DE FORMES D'ONDE NUMÉRIQUES À PARTIR D'UN SÉQUENÇAGE DE PROCHAINE GÉNÉRATION DE LECTURE SÉRIELLE PERMETTANT LA PRISE EN CHARGE D'UN APPEL DE BASE INFORMATIQUE DISTANT
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international    Formuler une observation

N° de publication : WO/2018/197374 N° de la demande internationale : PCT/EP2018/060263
Date de publication : 01.11.2018 Date de dépôt international : 23.04.2018
CIB :
G06F 19/28 (2011.01)
G PHYSIQUE
06
CALCUL; COMPTAGE
F
TRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19
Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10
Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
28
pour la programmation d'outils ou de systèmes de bases de données, p.ex. ontologies, intégration de données hétérogènes, entreposage de données ou architectures informatiques
Déposants :
KONINKLIJKE PHILIPS N.V. [NL/NL]; High Tech Campus 5 5656 AE Eindhoven, NL
Inventeurs :
GROSS, Brian, David; NL
Mandataire :
DE HAAN, Poul, Erik; NL
Données relatives à la priorité :
62/490,72027.04.2017US
Titre (EN) COMPRESSION AND ANNOTATION OF DIGITAL WAVEFORMS FROM SERIAL READ NEXT GENERATION SEQUENCING TO SUPPORT REMOTE COMPUTING BASE CALLING
(FR) COMPRESSION ET ANNOTATION DE FORMES D'ONDE NUMÉRIQUES À PARTIR D'UN SÉQUENÇAGE DE PROCHAINE GÉNÉRATION DE LECTURE SÉRIELLE PERMETTANT LA PRISE EN CHARGE D'UN APPEL DE BASE INFORMATIQUE DISTANT
Abrégé :
(EN) A method (100) for processing sequencing data, including: (i) generating (120), by a sequencing platform, a plurality of sequencing signals from a sequencing operation, each of the plurality of sequencing signals representing a genetic sequence; (ii) sampling (130), by a controller, each of the plurality of sequencing signals at a Nyquist rate of the sequencing platform to generate an upsampled signal; (iii) receiving (140), for each of the plurality of sequencing signals, the respective upsampled signal and information associated with the respective sequencing signal, comprising a base pair read number and a time stamp for the respective sequencing signal; (iv) packaging (150), by the controller for each sequencing signal, the received upsampled signal, base pair read number, and time stamp into a data packet; (v) organizing (160) the packaged data packets into a multiplexed single data stream; and (vi) transmitting (170) the multiplexed single data stream to a remote system.
(FR) L'invention concerne un procédé (100) de traitement de données de séquençage comprenant : (i) la génération (120), par une plateforme de séquençage, d'une pluralité de signaux de séquençage à partir d'une opération de séquençage, chaque signal de séquençage de la pluralité de signaux de séquençage représentant une séquence génétique ; (ii) l'échantillonnage (130), par un dispositif de commande, de chaque signal de séquençage de la pluralité de signaux de séquençage à un taux de Nyquist de la plateforme de séquençage afin de générer un signal suréchantillonné ; (iii) la réception(140), pour chaque signal de la pluralité de signaux de séquençage, du signal suréchantillonné respectif et d'informations associées au signal de séquençage respectif, comprenant un numéro de lecture de paire de base et un horodatage du signal de séquençage respectif ; (iv) l'encapsulage (150), par le dispositif de commande pour chaque signal de séquençage, du signal suréchantillonné reçu, du numéro de lecture de paire de base et de l'horodatage dans un paquet de données ; (v) l'organisation (160) des paquets de données encapsulées en un flux de données unique multiplexé ; et (vi) la transmission (170) du flux de données unique multiplexé à un système distant.
front page image
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)