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1. (WO2018160925) PROCÉDÉS ET SYSTÈMES DE PRÉDICTION DES RÉPONSES AU TRAITEMENT CHEZ DES SUJETS
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N° de publication : WO/2018/160925 N° de la demande internationale : PCT/US2018/020586
Date de publication : 07.09.2018 Date de dépôt international : 02.03.2018
CIB :
C12Q 1/68 (2018.01) ,G01N 33/48 (2006.01) ,G06F 19/18 (2011.01) ,G06F 19/20 (2011.01)
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
12
BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
Q
PROCÉDÉS DE MESURE, DE RECHERCHE OU D'ANALYSE FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1
Procédés de mesure, de recherche ou d'analyse faisant intervenir des enzymes ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68
faisant intervenir des acides nucléiques
G PHYSIQUE
01
MÉTROLOGIE; ESSAIS
N
RECHERCHE OU ANALYSE DES MATÉRIAUX PAR DÉTERMINATION DE LEURS PROPRIÉTÉS CHIMIQUES OU PHYSIQUES
33
Recherche ou analyse des matériaux par des méthodes spécifiques non couvertes par les groupes G01N1/-G01N31/146
48
Matériau biologique, p.ex. sang, urine; Hémocytomètres
G PHYSIQUE
06
CALCUL; COMPTAGE
F
TRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19
Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10
Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
18
pour la génomique ou la protéomique fonctionnelle, p.ex. associations génotype-phénotype, déséquilibre de liaison, mutagénèse, génotypage ou annotation génomique, interactions protéines-protéines ou interactions protéines-acides nucléiques
G PHYSIQUE
06
CALCUL; COMPTAGE
F
TRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19
Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10
Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
20
pour l'hybridation ou l'expression génique, p.ex. microréseaux, séquençage par hybridation, normalisation, profilage, modèles de correction de bruit, estimation du ratio d'expression, conception ou optimisation de sonde
Déposants :
PRESIDENT AND FELLOWS OF HARVARD COLLEGE [US/US]; 17 Qunicy Street Cambridge, Massachusetts 02138, US
Inventeurs :
BEAM, Andrew L.; US
KOHANE, Isaac S.; US
PALMER, Nathan; US
Mandataire :
RESNICK, David S.; US
Données relatives à la priorité :
62/466,21302.03.2017US
Titre (EN) METHODS AND SYSTEMS FOR PREDICTING TREATMENT RESPONSES IN SUBJECTS
(FR) PROCÉDÉS ET SYSTÈMES DE PRÉDICTION DES RÉPONSES AU TRAITEMENT CHEZ DES SUJETS
Abrégé :
(EN) Embodiments of various aspects described herein are directed to methods, systems, and computer readable media for predicting response of cells in vitro or in vivo (e.g., in a subject) to at least one or more agents (e.g., a library of agents). Methods, systems, and computer readable media described herein generally involve a computational algorithm to predict an expected post-treatment genome-wide expression profile of a cell or subject induced by an agent. The expected post-treatment genome-wide expression can be computed as a function of a pre-treatment genome-wide expression profile of the subject and known effects of the agent on gene expression in cells. Methods, systems, and computer readable media described herein can be used for drug repositioning, to select an appropriate treatment for a diseased subject, and/or to identify responsive subjects for a particular treatment.
(FR) Les modes de réalisation de la présente invention de divers aspects décrits dans la description concernent des procédés, des systèmes, et des supports lisibles par ordinateur afin de prédire la réponse de cellules in vitro ou in vivo (par exemple, chez un sujet) à au moins un ou plusieurs agents (par exemple, une bibliothèque d'agents). Les procédés, les systèmes, et les supports lisibles par ordinateur décrits dans la description impliquent généralement un algorithme de calcul pour prédire un profil d'expression prévu post-traitement de la largeur du génome d'une cellule ou d'un sujet induit(e) par un agent. L'expression prévue post-traitement de la largeur du génome peut être calculée comme fonction d'un profil d'expression de prétraitement de la largeur du génome du sujet et des effets connus de l'agent sur l'expression des gènes dans les cellules. Des procédés, des systèmes, et des supports lisibles par ordinateur décrits dans la description peuvent être utilisés pour le repositionnement de médicament, afin de sélectionner un traitement approprié pour un sujet malade, et/ou d'identifier les sujets sensibles à un traitement particulier.
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Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)