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1. (WO2018140452) ENRICHISSEMENT EN ADN ACELLULAIRE À PARTIR D'UN ÉCHANTILLON BIOLOGIQUE
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N° de publication : WO/2018/140452 N° de la demande internationale : PCT/US2018/014980
Date de publication : 02.08.2018 Date de dépôt international : 24.01.2018
CIB :
C12N 15/10 (2006.01) ,C12Q 1/68 (2018.01)
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
12
BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
N
MICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
15
Techniques de mutation ou génie génétique; ADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p.ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purification; Utilisation d'hôtes pour ceux-ci
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Technologie d'ADN recombinant
10
Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
12
BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
Q
PROCÉDÉS DE MESURE, DE RECHERCHE OU D'ANALYSE FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
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Procédés de mesure, de recherche ou d'analyse faisant intervenir des enzymes ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
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faisant intervenir des acides nucléiques
Déposants :
MYRIAD WOMEN'S HEALTH, INC. [US/US]; 180 Kimball Way South San Francisco, California 94080, US
Inventeurs :
WELKER, Noah C.; US
CHU, Clement S.; US
Mandataire :
BOYD, Victoria L.; US
PASS, Jason M.; US
Données relatives à la priorité :
62/452,14530.01.2017US
Titre (EN) ENRICHMENT OF CELL-FREE DNA FROM A BIOLOGICAL SAMPLE
(FR) ENRICHISSEMENT EN ADN ACELLULAIRE À PARTIR D'UN ÉCHANTILLON BIOLOGIQUE
Abrégé :
(EN) Provided are methods and compositions for enriching cfDNA fragments from a biological fluid sample. A biological fluid sample, such as a urine sample, is collected and, in certain examples, pretreated before enrichment of the cfDNA. For the pretreatment, the sample is centrifuged to remove large cells and large cellular debris. As part of the pretreatment, the sample is also cleared of additional large cellular debris and excess volume by subjecting the sample to anion exchange chromatography and eluting bound DNA. Following any pretreatment of the sample, different concentrations an alcoholic solution are used -- along with a mixture of DNA-binding particles and a chaotropic agent -- to enrich the sample with cfDNA fragments having different sizes. For example, a biological sample can be enriched with small cfDNA fragments less than about 100 base pairs in length or large cfDNA fragments greater than about 100 base pairs in length.
(FR) L'invention concerne des procédés et des compositions pour enrichir des fragments d'ADN acellulaire (cfADN) à partir d'un échantillon de fluide biologique. Un échantillon de fluide biologique, tel qu'un échantillon d'urine, est collecté et, dans certains exemples, prétraité avant l'enrichissement en cfADN. Pour le prétraitement, l'échantillon est centrifugé pour éliminer de grandes cellules et de gros débris cellulaires. Dans le cadre du prétraitement, l'échantillon est également débarrassé des gros débris cellulaires supplémentaires et du volume excédentaire par la soumission de l'échantillon à une chromatographie par échange d'anions et à l'élution de l'ADN lié. Après un prétraitement quelconque de l'échantillon, différentes concentrations d'une solution alcoolique sont utilisées -- conjointement avec un mélange de particules de liaison à l'ADN et d'un agent chaotropique -- pour enrichir l'échantillon en fragments de cfADN de différentes tailles. Par exemple, un échantillon biologique peut être enrichi en de petits fragments de cfADN inférieurs à environ 100 paires de bases en longueur ou en de grands fragments de cfADN supérieurs à environ 100 paires de bases en longueur.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)