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1. (WO2018129120) PROCÉDÉS POUR LA DÉTECTION DES MODIFICATIONS DE CYTOSINE

Pub. No.:    WO/2018/129120    International Application No.:    PCT/US2018/012288
Publication Date: Fri Jul 13 01:59:59 CEST 2018 International Filing Date: Fri Jan 05 00:59:59 CET 2018
IPC: C07H 21/00
C07H 21/02
C12Q 1/00
C12Q 1/68
Applicants: THE UNIVERSITY OF CHICAGO
Inventors: HE, Chuan
LU, Xingyu
HU, Lulu
Title: PROCÉDÉS POUR LA DÉTECTION DES MODIFICATIONS DE CYTOSINE
Abstract:
La présente invention concerne un procédé qui peut marquer de manière spécifique et amplifier directement le site 5hmC sur l'ADN génomique sans traitement d'abaissement ou au bisulfite, ce qui permet de cartographier le site 5hmC à partir d'une seule molécule d'ADN. Selon des aspects, l'invention concerne un procédé de détection de bases d'acide nucléique de 5-hydroxyméthylcytosine (5hmC) dans une molécule d'acide nucléique ou une pluralité de molécules d'acide nucléique, le procédé comprenant : a. modification de la base d'acide nucléique 5hmC avec un premier groupe fonctionnel ; b. fixation covalente d'une sonde d'acide nucléique modifiée comprenant un second groupe fonctionnel au premier groupe fonctionnel ; la sonde d'acide nucléique et la molécule d'acide nucléique étant liées de manière covalente par l'intermédiaire des premier et second groupes fonctionnels ; c. recuit d'une amorce à la sonde d'acide nucléique ; d. réalisation d'une extension d'amorce de l'amorce recuite pour fabriquer un nouveau brin ; et e. détection du nouveau brin.