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1. (WO2018112100) DÉTERMINATION D'UN ÉTAT PHYSIOLOGIQUE CHEZ UN INDIVIDU PAR ANALYSE DE POINTS D'EXTRÉMITÉ DE FRAGMENT D'ADN ACELLULAIRE DANS UN ÉCHANTILLON BIOLOGIQUE
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N° de publication : WO/2018/112100 N° de la demande internationale : PCT/US2017/066210
Date de publication : 21.06.2018 Date de dépôt international : 13.12.2017
CIB :
C12Q 1/68 (2018.01) ,G01N 33/50 (2006.01)
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
12
BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
Q
PROCÉDÉS DE MESURE, DE RECHERCHE OU D'ANALYSE FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1
Procédés de mesure, de recherche ou d'analyse faisant intervenir des enzymes ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68
faisant intervenir des acides nucléiques
G PHYSIQUE
01
MÉTROLOGIE; ESSAIS
N
RECHERCHE OU ANALYSE DES MATÉRIAUX PAR DÉTERMINATION DE LEURS PROPRIÉTÉS CHIMIQUES OU PHYSIQUES
33
Recherche ou analyse des matériaux par des méthodes spécifiques non couvertes par les groupes G01N1/-G01N31/146
48
Matériau biologique, p.ex. sang, urine; Hémocytomètres
50
Analyse chimique de matériau biologique, p.ex. de sang, d'urine; Recherche ou analyse par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligands; Recherche ou analyse immunologique
Déposants : BELLWETHER BIO, INC.[US/US]; 7710 Crest Drive NE Seattle, Washington 98115, US
Inventeurs : SNYDER, Matthew William; US
SHENDURE, Jay; US
Mandataire : ANDERTON, H. Thomas Jr.; US
GUSLER, Gloria; US
KERRIGAN, Cameron; US
LAI, Karen; US
LIU, Qun; US
LUPKOWSKI, Mark; US
MORALES, Norman; US
OSTOMEL, Todd; US
PATHAK, Rahul; US
REED, James L.; US
RICE, Janice V.; US
Données relatives à la priorité :
62/433,73713.12.2016US
Titre (EN) DETERMINING A PHYSIOLOGICAL CONDITION IN AN INDIVIDUAL BY ANALYZING CELL-FREE DNA FRAGMENT ENDPOINTS IN A BIOLOGICAL SAMPLE
(FR) DÉTERMINATION D'UN ÉTAT PHYSIOLOGIQUE CHEZ UN INDIVIDU PAR ANALYSE DE POINTS D'EXTRÉMITÉ DE FRAGMENT D'ADN ACELLULAIRE DANS UN ÉCHANTILLON BIOLOGIQUE
Abrégé :
(EN) Disclosed is a method for using cell-free DNA (cfDNA) to diagnose certain conditions in a subject. Specifically, the method comprising: isolating a plurality of cfDNA fragments from a biological sample from the subject; sequencing at least a portion of the plurality of cfDNA fragments; mapping a plurality of cfDNA fragments to a reference genome; assigning to each of a plurality of genomic positions a first value corresponding to the number of cfDNA fragments having their leftmost endpoint at said position and a second value corresponding to the number of cfDNA fragment having their rightmost endpoint at said position; comparing the first value and the second value from the subject to corresponding values in a reference dataset from one or more reference subjects; and identifying a probability of the condition in the subject based on the correlation of the subject's first value and second value to the corresponding values.
(FR) L'invention concerne un procédé d'utilisation d'ADN acellulaire pour diagnostiquer certains états.
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États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
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Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)