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1. (WO2018100431) PROCÉDÉ DE CONCEPTION D’UN ENSEMBLE DE SÉQUENCES POLYNUCLÉOTIDIQUES DESTINÉ À L’ANALYSE D’ÉVÉNEMENTS SPÉCIFIQUES DANS UNE RÉGION GÉNÉTIQUE D’INTÉRÊT
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N° de publication : WO/2018/100431 N° de la demande internationale : PCT/IB2017/001600
Date de publication : 07.06.2018 Date de dépôt international : 29.11.2017
CIB :
C12Q 1/6869 (2018.01) ,C12Q 1/6874 (2018.01) ,C12N 9/12 (2006.01) ,C12Q 1/6841 (2018.01) ,C12Q 1/6883 (2018.01) ,G06F 19/20 (2011.01)
[IPC code unknown for C12Q 1/6869][IPC code unknown for C12Q 1/6874][IPC code unknown for C12N 9/12][IPC code unknown for C12Q 1/6841][IPC code unknown for C12Q 1/6883][IPC code unknown for G06F 19/20]
Déposants :
GENOMIC VISION [FR/FR]; 80-84, rue des Meuniers 92220 Bagneux, FR
Inventeurs :
BERTHOUMIEUX, Sarah; FR
FOURNE, Yannick; FR
KOMATSU, Jun; FR
FER, Frédéric; FR
BENSIMON, Aaron; FR
Mandataire :
ERNEST GUTMANN - YVES PLASSERAUD SAS; 3, rue Auber 75009 Paris, FR
Données relatives à la priorité :
62/427,58029.11.2016US
Titre (EN) METHOD FOR DESIGNING A SET OF POLYNUCLEOTIDE SEQUENCES FOR ANALYSIS OF SPECIFIC EVENTS IN A GENETIC REGION OF INTEREST
(FR) PROCÉDÉ DE CONCEPTION D’UN ENSEMBLE DE SÉQUENCES POLYNUCLÉOTIDIQUES DESTINÉ À L’ANALYSE D’ÉVÉNEMENTS SPÉCIFIQUES DANS UNE RÉGION GÉNÉTIQUE D’INTÉRÊT
Abrégé :
(EN) Methods including in-silico steps for design and synthesis of Genomic Morse Code ("GMC") probes including design of combinations of polynucleotide sequences and labelling colors for analysis of large rearrangements in targeted genetic regions as well as allele characterization of complex regions and localization of events such as replication, DNA reparation or epigenetics in particular regions. Color-encoded sets of probes that produce characteristic or unique color patterns when painted on a target nucleic acid sequence. Methods for using color-encoded sets of probes.
(FR) La présente invention concerne des procédés comprenant des étapes in-silico destinées à la conception et à la synthèse de sondes de code Morse génomique ("GMC"), les procédés consistant en : la conception de combinaisons de séquences polynucléotidiques et de couleurs de marquage pour l’analyse de grands réarrangements dans des régions génétiques ciblées ainsi que la caractérisation d’allèle de régions complexes et la localisation d’événements tels que la réplication, la réparation d’ADN ou l’épigénétique dans des régions particulières. Des ensembles codés par couleur de sondes qui produisent des motifs de couleur caractéristiques ou uniques lorsqu’ils sont peints sur une séquence d’acides nucléiques cible. La présente invention concerne également des procédés d’utilisation d’ensembles de sondes codés par couleur.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)