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1. (WO2018096058) CODE-BARRES EN TANDEM DE MOLÉCULES CIBLES POUR LEUR QUANTIFICATION ABSOLUE À UNE RÉSOLUTION D'ENTITÉ UNIQUE
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N° de publication :    WO/2018/096058    N° de la demande internationale :    PCT/EP2017/080264
Date de publication : 31.05.2018 Date de dépôt international : 23.11.2017
CIB :
C12Q 1/68 (2018.01)
Déposants : UNIVERSITE DE STRASBOURG [FR/FR]; 4 rue Blaise Pascal 67000 STRASBOURG (FR).
CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE [FR/FR]; 3 rue Michel Ange 75016 PARIS (FR)
Inventeurs : RYCKELYNCK, Michaël; (FR).
BAUDREY, Stéphanie; (FR)
Mandataire : CABINET BECKER ET ASSOCIES; 25, rue Louis le Grand 75002 PARIS (FR)
Données relatives à la priorité :
16306543.6 23.11.2016 EP
Titre (EN) TANDEM BARCODING OF TARGET MOLECULES FOR THEIR ABSOLUTE QUANTIFICATION AT SINGLE-ENTITY RESOLUTION
(FR) CODE-BARRES EN TANDEM DE MOLÉCULES CIBLES POUR LEUR QUANTIFICATION ABSOLUE À UNE RÉSOLUTION D'ENTITÉ UNIQUE
Abrégé : front page image
(EN)The present invention relates to a new method of labelling any target molecules from a plurality of entities, preferably in high throughput regimes, i.e. allowing the analysis of several thousands of entities per run, while preserving the integrity of the single-entity information. This method is based on a tandem molecular barcoding in which all molecular targets are labelled with a first unique barcode which is different for each molecular target from an entity, and with a tag sequence coding the entity from which the molecular target originates. Once this tandem barcoding is performed, the absolute quantification of all molecular targets with a single-entity resolution may be carried out in a single run of next-generation sequencing. The present invention also relates to a method of quantifying one or several molecular targets from a plurality of entities with single-entity resolution, as well as a kit and the use of such kit to label a plurality of molecular targets from a plurality of entities according to the method of the invention.
(FR)La présente invention concerne un nouveau procédé d'étiquetage de molécules cibles quelconques à partir d'une pluralité d'entités, préférablement dans des régimes à haut débit, permettant l'analyse de plusieurs milliers d'entités par passage, tout en maintenant l'intégrité de l'information d'entité unique. Ce procédé est basé sur un code-barres moléculaire en tandem dans lequel toutes les cibles moléculaires sont étiquetées avec un premier code-barres unique qui est différent pour chaque cible moléculaire depuis une entité, et avec une séquence étiquette codant l'entité depuis laquelle provient la cible moléculaire. Une fois que ce code-barres en tandem est exécuté, la quantification absolue de toutes les cibles moléculaires avec une résolution d'entité unique peut être conduite en un passage unique de séquençage de nouvelle génération. La présente invention concerne également un procédé de quantification d'une ou plusieurs cibles moléculaires à partir d'une pluralité d'entités avec résolution d'entité unique, ainsi qu'un kit et l'utilisation d'un tel kit pour étiqueter une pluralité de cibles moléculaires à partir d'une pluralité d'entités selon le procédé de l'invention.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)