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1. (WO2018093658) VALIDATION DE VOIES ANTICANCÉREUSES INFÉRÉES
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N° de publication : WO/2018/093658 N° de la demande internationale : PCT/US2017/060872
Date de publication : 24.05.2018 Date de dépôt international : 09.11.2017
CIB :
G06F 19/12 (2011.01)
G PHYSIQUE
06
CALCUL; COMPTAGE
F
TRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19
Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10
Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
12
pour la modélisation ou la simulation en biologie des systèmes, p.ex. modèles probabilistes ou dynamiques, réseaux régulateurs de gènes, réseaux d'interaction protéique ou réseaux métaboliques
Déposants :
NANTBIO, INC. [US/US]; 9920 Jefferson Boulevard Culver City, California 90232, US
NANT HOLDINGS IP, LLC [US/US]; 9922 Jefferson Boulevard Culver City, California 90232, US
Inventeurs :
NIAZI, Kayvan; US
RABIZADEH, Shahrooz; US
WITCHEY, Nicholas J.; US
Mandataire :
MERCANTI, Michael, N.; US
Données relatives à la priorité :
62/423,75917.11.2016US
Titre (EN) VALIDATION OF INFERRED ANTICANCER PATHWAYS
(FR) VALIDATION DE VOIES ANTICANCÉREUSES INFÉRÉES
Abrégé :
(EN) The invention provides a method of validating a predicted pathway activity of a pathway in a solid tumor of a subject, with a digital computer, the method comprising : a) obtaining a tumor associated sample from the subject; b) obtaining omics data from the tumor associated sample obtained in (a); c) applying the omics data obtained in (b) to a digital computer programmed with a pathway analysis engine configured to generate predicted tumor cell pathway activities in silico, to provide a prediction of one or more pharmaceutically active anticancer compounds effective for treating the subject's tumor; d) obtaining enriched viable tumor cells from the subject, and interrogating the enriched viable tumor cells with at least one pharmaceutically active compound known to interact with a pathway element of one or more of the pathways predicted by (c), to measure anticancer activity of the at least one pharmaceutically active compound with respect to the subject's enriched viable tumor cells.
(FR) L'invention concerne un procédé de validation d'une activité de voie prédite d'une voie dans une tumeur solide d'un sujet, à l'aide d'un calculateur numérique, le procédé comportant les étapes consistant à: a) obtenir un échantillon associé à une tumeur à partir du sujet; b) obtenir des données "omiques" à partir de l'échantillon associé à la tumeur obtenu en (a); c) appliquer les données "omiques" obtenues en (b) à un calculateur numérique programmé avec un moteur d'analyse de voie configuré pour générer des activités prédites de voie de cellules tumorales in silico, pour donner une prédiction d'un ou plusieurs composés anticancéreux pharmacologiquement actifs efficaces pour traiter la tumeur du sujet; d) obtenir des cellules tumorales viables enrichies (EVTC) à partir du sujet, et interroger les cellules tumorales viables enrichies avec au moins un composé pharmacologiquement actif connu pour interagir avec un élément de voie d'une ou plusieurs des voies prédites par (c), pour mesurer l'activité anticancéreuse du ou des composés pharmacologiquement actifs par rapport aux cellules tumorales viables enrichies du sujet.
front page image
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)