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1. (WO2018089927) IDENTIFICATION D'ALTÉRATIONS SOMATIQUES DE GÉNOME SPÉCIFIQUES D'UNE INSTANCE AYANT UN IMPACT FONCTIONNEL

Pub. No.:    WO/2018/089927    International Application No.:    PCT/US2017/061373
Publication Date: Fri May 18 01:59:59 CEST 2018 International Filing Date: Tue Nov 14 00:59:59 CET 2017
IPC: C12Q 1/6886
G06F 19/20
Applicants: UNIVERSITY OF PITTSBURGH - OF THE COMMONWEALTH SYSTEM OF HIGHER EDUCATION
Inventors: LU, Xinghua
COOPER, Gregory
CAI, Chunhui
VISWESWARAN, Shyam
Title: IDENTIFICATION D'ALTÉRATIONS SOMATIQUES DE GÉNOME SPÉCIFIQUES D'UNE INSTANCE AYANT UN IMPACT FONCTIONNEL
Abstract:
La présente invention concerne des procédés permettant l'identification d'altérations somatiques de génome ayant un impact fonctionnel dans le génome d'une tumeur. Selon plusieurs modes de réalisation, les procédés comprennent la génération d'un réseau bayésien causal bipartite ayant une probabilité postérieure maximale comprenant des bords causals pointant des gènes comprenant des mutations somatiques et des altérations somatiques du nombre de copies dans le génome de la tumeur aux gènes ayant une expression différentielle dans la tumeur. Les procédés peuvent être utilisés, par exemple, pour identifier des altérations somatiques du génome vecteurs dans le génome d'une tumeur.