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1. (WO2018089377) PROCÉDÉS DE CLASSIFICATION DE MARQUEURS CELLULAIRES
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N° de publication : WO/2018/089377 N° de la demande internationale : PCT/US2017/060447
Date de publication : 17.05.2018 Date de dépôt international : 07.11.2017
CIB :
C12Q 1/6869
[IPC code unknown for C12Q 1/6869]
Déposants :
CELLULAR RESEARCH, INC. [US/US]; 4040 Campbell Avenue, Suite 110 Menlo Park, CA 94025, US
Inventeurs :
HU, Jing; US
FAN, Christina; US
ROSENFELD, David; US
FAN, Jue; US
WALCZAK, Elisabeth, Marie; US
Mandataire :
MALLON, Joseph, J.; US
Données relatives à la priorité :
62/419,19408.11.2016US
62/445,54612.01.2017US
Titre (EN) METHODS FOR CELL LABEL CLASSIFICATION
(FR) PROCÉDÉS DE CLASSIFICATION DE MARQUEURS CELLULAIRES
Abrégé :
(EN) Disclosed herein are methods and systems for classifying cell labels, for example identifying a signal cell label. In some embodiments, the method comprises: obtaining sequencing data of barcoded targets created using targets in cells barcoded using barcodes, wherein a barcode comprises a cell label and a molecular label. After ranking the cell labels, a minimum of a second derivative plot of a cumulative sum plot can be determined. Using the methods, a cell label can be classified as a signal cell label or a noise cell label based on the number of molecular labels with distinct sequences associated with the cell label and a cell label threshold.
(FR) L'invention concerne des procédés et des systèmes permettant la classification de marqueurs cellulaires, par exemple l'identification d'un marqueur cellulaire signal. Selon certains modes de réalisation, le procédé comprend les étapes consistant : à obtenir des données de séquençage de cibles à code-barres créées à l'aide de cibles dans des cellules dotées de codes-barres à l'aide de codes-barres, un code-barres comprenant un marqueur cellulaire et un marqueur moléculaire. Après le classement des marqueurs cellulaires, un minimum d'un second tracé dérivé d'un tracé de somme cumulée peut être déterminé. En mettant en œuvre les procédés, un marqueur cellulaire peut être classé comme marqueur cellulaire signal ou marqueur cellulaire de bruit sur la base du nombre de marqueurs moléculaires avec des séquences distinctes associées au marqueur cellulaire et d'un seuil de marqueur cellulaire.
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États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
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Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)