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1. (WO2018084640) PROCÉDÉ DE PRÉPARATION D'UNE BIBLIOTHÈQUE D'ADN DÉRIVÉE DE TISSU FFPE À L'AIDE D'ENDONUCLÉASE

Pub. No.:    WO/2018/084640    International Application No.:    PCT/KR2017/012421
Publication Date: Sat May 12 01:59:59 CEST 2018 International Filing Date: Sat Nov 04 00:59:59 CET 2017
IPC: C12N 15/10
C12Q 1/68
C40B 40/06
C40B 50/06
Applicants: UNIVERSITY OF ULSAN FOUNDATION FOR INDUSTRY COOPERATION
울산대학교 산학협력단
THE ASAN FOUNDATION
재단법인 아산사회복지재단
Inventors: JANG, Se-Jin
장세진
CHUN, Sung-Min
천성민
SUNG, Chang Ohk
성창옥
KIM, Yu Jin
김유진
LEE, Ji-Young
이지영
JEON, Hye-Joon
전혜준
Title: PROCÉDÉ DE PRÉPARATION D'UNE BIBLIOTHÈQUE D'ADN DÉRIVÉE DE TISSU FFPE À L'AIDE D'ENDONUCLÉASE
Abstract:
La présente invention concerne un procédé de préparation d'une bibliothèque d'ADN dérivée de tissu FFPE (fixé à la formaline/inclus dans la paraffine) à l'aide d'une endonucléase. Une majorité d'échantillons cliniques courants sont un tissu FFPE et, dans le cas de tissu FFPE ancien, il se produit souvent des cas où la production d'une bibliothèque d'ADN échoue et où les analyses par NGS (séquençage de nouvelle génération) deviennent difficiles, de telle sorte qu'il existe un besoin désespéré de surmonter ce problème. Une nucléase S1 est une enzyme qui ne clive spécifiquement que l'ADN simple brin et dans presque tous les FFPE, il existe des coupures dans l'ADN double brin qui peuvent être une cible de la nucléase S1. Dans le procédé d'extraction d'ADNg à partir de tissu FFPE, lorsque la nucléase S1 est traitée et éluée dans des conditions appropriées pendant le processus d'élution, l'ADN fragmenté en ADN d'une dimension appropriée pour produire une bibliothèque d'ADN peut être obtenu en même temps que l'extraction d'ADN, de telle sorte qu'un processus de fragmentation de Covaris peut être omis et les coûts et le temps peuvent être réduits.