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1. (WO2018081130) MÉTHODES ET SYSTÈMES DE DÉTECTION D'UNE TUMEUR
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N° de publication : WO/2018/081130 N° de la demande internationale : PCT/US2017/058099
Date de publication : 03.05.2018 Date de dépôt international : 24.10.2017
CIB :
C12Q 1/68 (2018.01) ,G01N 33/574 (2006.01) ,G06F 19/18 (2011.01)
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
12
BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
Q
PROCÉDÉS DE MESURE, DE RECHERCHE OU D'ANALYSE FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1
Procédés de mesure, de recherche ou d'analyse faisant intervenir des enzymes ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68
faisant intervenir des acides nucléiques
G PHYSIQUE
01
MÉTROLOGIE; ESSAIS
N
RECHERCHE OU ANALYSE DES MATÉRIAUX PAR DÉTERMINATION DE LEURS PROPRIÉTÉS CHIMIQUES OU PHYSIQUES
33
Recherche ou analyse des matériaux par des méthodes spécifiques non couvertes par les groupes G01N1/-G01N31/146
48
Matériau biologique, p.ex. sang, urine; Hémocytomètres
50
Analyse chimique de matériau biologique, p.ex. de sang, d'urine; Recherche ou analyse par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligands; Recherche ou analyse immunologique
53
Essais immunologiques; Essais faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques; Matériaux à cet effet
574
pour le cancer
G PHYSIQUE
06
CALCUL; COMPTAGE
F
TRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19
Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10
Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
18
pour la génomique ou la protéomique fonctionnelle, p.ex. associations génotype-phénotype, déséquilibre de liaison, mutagénèse, génotypage ou annotation génomique, interactions protéines-protéines ou interactions protéines-acides nucléiques
Déposants :
THE CHINESE UNIVERSITY OF HONG KONG [CN/CN]; Room 301, Pi Ch'iu Building Shatin, New Territories Hong Kong, CN
GRAIL, INC. [US/US]; US
Inventeurs :
NAMSARAEV, Eugeni; US
LO, Yuk-Ming Dennis; CN
CHUI, Rossa Wai Kwun; CN
CHAN, Kwan Chee; CN
JIANG, Peiyong; CN
SUN, Kun; CN
LAM, Wai Kei; CN
Mandataire :
HARIHARAN, Venkatesh; US
SEIDEL, Jeffrey; US
Données relatives à la priorité :
62/411,92924.10.2016US
62/450,54125.01.2017US
62/507,15416.05.2017US
Titre (EN) METHODS AND SYSTEMS FOR TUMOR DETECTION
(FR) MÉTHODES ET SYSTÈMES DE DÉTECTION D'UNE TUMEUR
Abrégé :
(EN) Methods are provided to improve the positive predictive value for cancer detection using cell-free nucleic acid samples. Various embodiments are directed to applications (e.g., diagnostic applications) of the analysis of the fragmentation patterns and size of cell-free DNA, e.g., plasma DNA and serum DNA, including nucleic acids from pathogens, including viruses. Embodiments of one application can determine if a subject has a particular condition. For example, a method of present disclosure can determine if a subject has cancer or a tumor, or other pathology. Embodiments of another application can be used to assess the stage of a condition, or the progression of a condition over time. For example, a method of the present disclosure may be used to determine a stage of cancer in a subject, or the progression of cancer in a subject over time (e.g., using samples obtained from a subject at different times).
(FR) La présente divulgation concerne des méthodes destinées à améliorer la valeur prédictive positive en matière de dépistage du cancer à l'aide d'échantillons d'acides nucléiques acellulaires. Divers modes de réalisation concernent des applications (p. ex., applications diagnostiques) de type analyse des motifs de fragmentation et de la taille de l'ADN acellulaire, p. ex., ADN plasmatique et ADN sérique, comprenant des acides nucléiques provenant d'agents pathogènes, y compris de virus. Des modes de réalisation d'une application permettent de déterminer si un sujet présente un état pathologique particulier. Par exemple, une méthode selon la présente divulgation peut déterminer si un sujet présente un cancer, une tumeur, ou autre pathologie. Des modes de réalisation d'une autre application peuvent être utilisés pour évaluer le stade d'un état pathologique, ou l'évolution d'un état pathologique dans le temps. Par exemple, une méthode selon la présente divulgation peut être utilisée pour déterminer le stade du cancer chez un sujet, ou l'évolution du cancer chez un sujet dans le temps (p. ex., à l'aide d'échantillons prélevés sur le sujet à différents moments).
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États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)