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1. (WO2018080477) SYSTÈMES ET PROCÉDÉS POUR UNE IDENTIFICATION ET DES ESTIMATIONS D'ABONDANCE ULTRARAPIDES DE MICRO-ORGANISMES À L'AIDE D'UNE APPROCHE BASÉE SUR LA PROFONDEUR DE K-MÈRES ET DE PROTOCOLES DE PRÉSERVATION DE LA CONFIDENTIALITÉ
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N° de publication : WO/2018/080477 N° de la demande internationale : PCT/US2016/058862
Date de publication : 03.05.2018 Date de dépôt international : 26.10.2016
CIB :
C12Q 1/68 (2006.01) ,G06F 19/10 (2011.01) ,G06F 19/16 (2011.01) ,G06F 19/22 (2011.01)
Déposants : THE JOAN & IRWIN JACOBS TECHNION-CORNELL INSTITUTE[US/US]; 111 8th Avenue Suite 302 New York, NY 10011, US
Inventeurs : O'HARA, Niamh, B.; US
OUNIT, Rachid; US
Mandataire : EMMONS, Richard, B.; US
AMENDT, Kevin, C.; US
BAUER, John, A.; US
ADAMS, Lisa; US
AZRIN, Linda, B.; US
Données relatives à la priorité :
Titre (EN) SYSTEMS AND METHODS FOR ULTRA-FAST IDENTIFICATION AND ABUNDANCE ESTIMATES OF MICROORGANISMS USING A KMER-DEPTH BASED APPROACH AND PRIVACY-PRESERVING PROTOCOLS
(FR) SYSTÈMES ET PROCÉDÉS POUR UNE IDENTIFICATION ET DES ESTIMATIONS D'ABONDANCE ULTRARAPIDES DE MICRO-ORGANISMES À L'AIDE D'UNE APPROCHE BASÉE SUR LA PROFONDEUR DE K-MÈRES ET DE PROTOCOLES DE PRÉSERVATION DE LA CONFIDENTIALITÉ
Abrégé : front page image
(EN) The present disclosure relates to the use of next generation technologies and analysis using a k-mer based approach which is depth-informed to classify microorganism and estimate abundance in single or mixed microorganismal populations in a rapid manner. The disclosure relates to methods for identifying taxa from environmentally or patient collected samples and processing these samples in a privacy-preserving manner.
(FR) La présente invention concerne l'utilisation de technologies et d'analyse de nouvelle génération à l'aide d'une approche basée sur les k-mères qui est informée en profondeur pour classifier un micro-organisme et estimer l'abondance dans des populations micro-organismales uniques ou mélangées d'une manière rapide. L'invention concerne des procédés d'identification de taxa à partir d'échantillons prélevés sur l'environnement ou des patients et de traitement de ces échantillons d'une manière préservant la confidentialité.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)