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1. (WO2018079579) PROCÉDÉ DE DÉTECTION D'UNE SÉQUENCE DE BASE CIBLE, PROCÉDÉ DE CONCEPTION ET DE PRODUCTION DE SONDE, ET KIT
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N° de publication : WO/2018/079579 N° de la demande internationale : PCT/JP2017/038458
Date de publication : 03.05.2018 Date de dépôt international : 25.10.2017
CIB :
C12Q 1/68 (2018.01) ,G01N 21/78 (2006.01) ,C12N 15/09 (2006.01)
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
12
BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
Q
PROCÉDÉS DE MESURE, DE RECHERCHE OU D'ANALYSE FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1
Procédés de mesure, de recherche ou d'analyse faisant intervenir des enzymes ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68
faisant intervenir des acides nucléiques
G PHYSIQUE
01
MÉTROLOGIE; ESSAIS
N
RECHERCHE OU ANALYSE DES MATÉRIAUX PAR DÉTERMINATION DE LEURS PROPRIÉTÉS CHIMIQUES OU PHYSIQUES
21
Recherche ou analyse des matériaux par l'utilisation de moyens optiques, c. à d. en utilisant des rayons infrarouges, visibles ou ultraviolets
75
Systèmes dans lesquels le matériau est soumis à une réaction chimique, le progrès ou le résultat de la réaction étant analysé
77
en observant l'effet sur un réactif chimique
78
produisant un changement de couleur
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
12
BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
N
MICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
15
Techniques de mutation ou génie génétique; ADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p.ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purification; Utilisation d'hôtes pour ceux-ci
09
Technologie d'ADN recombinant
Déposants :
栄研化学株式会社 EIKEN KAGAKU KABUSHIKI KAISHA [JP/JP]; 東京都台東区台東4丁目19番9号 4-19-9 Taito, Taito-ku, Tokyo 1108408, JP
Inventeurs :
道行 悟 MICHIYUKI, Satoru; JP
神田 秀俊 KANDA, Hidetoshi; JP
Mandataire :
葛和 清司 KUZUWA, Kiyoshi; JP
Données relatives à la priorité :
2016-20992926.10.2016JP
Titre (EN) METHOD FOR DETECTING TARGET BASE SEQUENCE, METHOD FOR DESIGNING AND PRODUCING PROBE, AND KIT
(FR) PROCÉDÉ DE DÉTECTION D'UNE SÉQUENCE DE BASE CIBLE, PROCÉDÉ DE CONCEPTION ET DE PRODUCTION DE SONDE, ET KIT
(JA) 標的塩基配列を検出する方法、プローブを設計および製造する方法ならびにキット
Abrégé :
(EN) The present invention addresses the issue of providing a target base sequence detection method, etc., whereby a determination can be readily made regarding whether or not a target base sequence is present in a nucleic acid sample. A fluorescent label detection probe and a competitive probe are added to a nucleic acid sample and caused to hybridize with the nucleic acid in the sample, the fluorescence intensity is measured while changing the temperature of the reaction sample, and first order differentiation is performed on a temperature – fluorescence intensity curve. The fluorescent label detection probe and competitive probe base length, base sequence, and amount to be added to nucleic acid samples are determined such that the first order derivative curve for a control target reaction sample including a target base sequence has a peak but the first order derivative curve for a control non-target reaction sample including a non-target base sequence does not substantially have a peak, when: the fluorescent label detection probe and the competitive probe are added to both the control target nucleic acid sample and the control non-target nucleic acid sample; the fluorescence intensity is measured while the temperature of both the obtained control target reaction sample and the control non-target reaction sample are changed; and first order differentiation is performed on a temperature – fluorescence intensity curve.
(FR) La présente invention aborde le problème consistant à fournir un procédé de détection de séquence de bases cible, etc., moyennant quoi une détermination peut être facilement effectuée quant à la présence ou non d'une séquence de bases cible dans un échantillon d'acide nucléique. Une sonde de détection de marqueur fluorescent et une sonde compétitive sont ajoutées à un échantillon d'acide nucléique et amenées à s'hybrider avec l'acide nucléique dans l'échantillon, l'intensité de fluorescence est mesurée tout en changeant la température de l'échantillon de réaction, et une différenciation de premier ordre est effectuée sur une courbe de température - intensité de fluorescence. La longueur de bases de la sonde de détection de marqueur fluorescent et de la sonde compétitive, la séquence de bases et la quantité à ajouter aux échantillons d'acide nucléique sont déterminées de telle sorte que la courbe dérivée de premier ordre pour un échantillon de réaction cible témoin comprenant une séquence de bases cible présente un pic mais la courbe dérivée de premier ordre pour un échantillon de réaction non cible témoin comprenant une séquence de bases non cible ne présente sensiblement pas de pic, lorsque : la sonde de détection de marqueur fluorescent et la sonde compétitive sont ajoutées à la fois à l'échantillon d'acide nucléique cible témoin et à l'échantillon d'acide nucléique non cible témoin ; l'intensité de fluorescence est mesurée tandis que la température à la fois de l'échantillon de réaction cible témoin obtenu et de l'échantillon de réaction non cible témoin sont modifiées ; et une différenciation de premier ordre est effectuée sur une courbe de température - intensité de fluorescence.
(JA) 核酸試料中に標的塩基配列が存在するか否かを容易に判断可能とすることができる、標的塩基配列を検出する方法等を提供することを課題とする。蛍光標識検出プローブと競合プローブとを核酸試料へ添加して試料中の核酸とハイブリダイズさせ、反応試料の温度を変化させながら蛍光強度を測定し、温度-蛍光強度曲線を一次微分する。蛍光標識検出プローブおよび競合プローブの塩基長、塩基配列、核酸試料への添加量は、標的塩基配列を含む対照標的核酸試料および非標的塩基配列を含む対照非標的核酸試料の夫々に、蛍光標識検出プローブと競合プローブとを加え、得られた対照標的反応試料および対照非標的反応試料の夫々の温度を変化させながら蛍光強度を測定し、温度-蛍光強度曲線を一次微分すると、対照標的反応試料の一次微分曲線がピークを有するが、対照非標的反応試料の一次微分曲線がピークを実質的に有さないように、決定される。
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États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : japonais (JA)
Langue de dépôt : japonais (JA)