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1. (WO2018064653) ASSEMBLAGE SOUSTRACTIF ET ASSEMBLAGE SOUSTRACTIF SIMULTANÉ DESTINÉS À LA MÉTAGÉNOMIQUE COMPARATIVE

Pub. No.:    WO/2018/064653    International Application No.:    PCT/US2017/054664
Publication Date: Fri Apr 06 01:59:59 CEST 2018 International Filing Date: Sun Oct 01 01:59:59 CEST 2017
IPC: G06F 19/10
C12Q 1/68
Applicants: INDIANA UNIVERSITY RESEARCH AND TECHNOLOGY CORPORATION
Inventors: YE, Yuzhen
Title: ASSEMBLAGE SOUSTRACTIF ET ASSEMBLAGE SOUSTRACTIF SIMULTANÉ DESTINÉS À LA MÉTAGÉNOMIQUE COMPARATIVE
Abstract:
Un procédé de caractérisation de gènes marqueurs microbiens associés à une maladie comprend les étapes consistant à : compter les k-mères d'au moins deux échantillons; charger les k-mères dans un réseau; extraire les séquences lues sur la base des signatures de séquences différentielles; et assembler les contigs et les annoter phylogénétiquement.