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1. (WO2018058023) MÉTHODES D'IDENTIFICATION DE PROTÉINES SE LIANT À DES LIGANDS

Pub. No.:    WO/2018/058023    International Application No.:    PCT/US2017/053207
Publication Date: Fri Mar 30 01:59:59 CEST 2018 International Filing Date: Tue Sep 26 01:59:59 CEST 2017
IPC: G01N 33/68
G01N 33/94
G01N 33/53
Applicants: UNIVERSITY OF PITTSBURGH - OF THE COMMONWEALTH SYSTEM OF HIGHER EDUCATION
BONDARENKO, Andrey
Inventors: BONDARENKO, Andrey
YATES, Nathan A.
MULLETT, Steven James
BELL-TEMIN, Harris B.
Title: MÉTHODES D'IDENTIFICATION DE PROTÉINES SE LIANT À DES LIGANDS
Abstract:
La présente invention concerne des méthodes d'identification d'une protéine pouvant se lier à un ligand, la méthode consistant à : (a) mettre en contact le ligand avec deux échantillons ou plus comprenant une pluralité de protéines dans une solution; (b) séparer les protéines liées au ligand (« protéines liées ») des protéines qui ne sont pas liées au ligand (« protéines non liées ») dans chaque échantillon; (c) dénaturer et digérer les protéines liées de sorte à former une pluralité de peptides dans chaque échantillon; (d) quantifier une pluralité de caractéristiques moléculaires contenues dans la pluralité de peptides dans chaque échantillon, les caractéristiques moléculaires étant définies comme présentant un rapport masse sur charge, un temps de rétention et une intensité de crête telles que mesurées par spectrométrie de masse; et (e) classer les caractéristiques moléculaires qui présentent une différence statistiquement significative en termes de quantité entre les échantillons mis en contact avec le ligand et un échantillon qui n'est pas mis en contact avec le ligand (« caractéristique moléculaire statistiquement significative »).