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1. (WO2018050844) PROCÉDÉ DE DÉTERMINATION D'UNE DÉGRADATION D'ACIDE NUCLÉIQUE DANS UN ÉCHANTILLON DANS LEQUEL AU MOINS DEUX AMPLICONS CHEVAUCHANTS SONT PRODUITS ET DEUX SONDES SONT UTILISÉES DANS LE PROCÉDÉ
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N° de publication : WO/2018/050844 N° de la demande internationale : PCT/EP2017/073323
Date de publication : 22.03.2018 Date de dépôt international : 15.09.2017
CIB :
C12Q 1/68
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
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BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
Q
PROCÉDÉS DE MESURE, DE RECHERCHE OU D'ANALYSE FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
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Procédés de mesure, de recherche ou d'analyse faisant intervenir des enzymes ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
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faisant intervenir des acides nucléiques
Déposants :
QIAGEN GMBH [DE/DE]; Qiagen Str. 1 40724 Hilden, DE
Inventeurs :
VRANES, Miroslav; DE
PEIST, Ralf; DE
SCHERER, Mario; DE
CORNELIUS, Stefan Otto; DE
Mandataire :
CH KILGER ANWALTSPARTNERSCHAFT MBB; Fasanenstr. 29 10719 Berlin, DE
Données relatives à la priorité :
16189217.916.09.2016EP
Titre (EN) METHOD FOR DETERMINING NUCLEIC ACID DEGRADATION IN A SAMPLE IN WHICH AT LEAST TWO OVERLAPPING AMPLICONS ARE PRODUCED AND TWO PROBES ARE USED IN THE METHOD
(FR) PROCÉDÉ DE DÉTERMINATION D'UNE DÉGRADATION D'ACIDE NUCLÉIQUE DANS UN ÉCHANTILLON DANS LEQUEL AU MOINS DEUX AMPLICONS CHEVAUCHANTS SONT PRODUITS ET DEUX SONDES SONT UTILISÉES DANS LE PROCÉDÉ
Abrégé :
(EN) The present invention relates to a method for assessing the status of nucleic acid degradation and/or integrity of one or more nucleic acids in a sample, comprising the steps amplifying at least two overlapping regions within at least one locus (e.g. by heminested or nested PCR), and detecting the amount of the at least two amplification products through the use of at least two probes, wherein one probe binds to the region of overlap and the at least one other probe binds to a non-overlapping region. The invention further relates to a method of designing primers and/or probes for amplifying at least two overlapping regions within at least one locus, wherein the locus that is amplified is a single copy locus (SCL) or multicopy locus (MLC). The invention also relates to a primer and a primer pair for amplifying at least two overlapping regions from one nucleic acid template which is a multicopy locus present in 21 loci in the human genome. These primers and probes may be in a kit. Hence, the invention also relates to a kit for assessing the status of nucleic acid degradation and/or integrity of one or more nucleic acids in a sample.
(FR) La présente invention concerne un procédé d'évaluation de l'état de dégradation et/ou d'intégrité d'acide nucléique d'un ou de plusieurs acides nucléiques dans un échantillon, comprenant les étapes consistant à amplifier au moins deux régions chevauchantes à l'intérieur d'au moins un locus (par exemple, par PCR semi-nichée ou nichée), et à détecter la quantité desdits au moins deux produits d'amplification par l'utilisation d'au moins deux sondes, une sonde se liant à la région de chevauchement et la ou les autres sondes se liant à une région non chevauchante. L'invention concerne en outre un procédé de conception d'amorces et/ou de sondes pour amplifier au moins deux régions se chevauchant à l'intérieur d'au moins un locus, le locus qui est amplifié étant un locus de copie unique (SCL) ou un locus multicopie (MLC). L'invention concerne également une amorce et une paire d'amorces pour amplifier au moins deux régions chevauchantes d'une matrice d'acide nucléique qui est un locus multicopie présent dans 21 loci dans le génome humain. Ces amorces et ces sondes peuvent être dans un kit. Par conséquent, l'invention concerne également un kit permettant d'évaluer l'état de dégradation et/ou d'intégrité d'acide nucléique d'un ou de plusieurs acides nucléiques dans un échantillon.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)