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1. (WO2018049026) DOSAGE SRM/MRM POUR LA PROTÉINE DE LA CHAÎNE BÊTA -3 DE LA TUBULINE (TUBB3)
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N° de publication : WO/2018/049026 N° de la demande internationale : PCT/US2017/050472
Date de publication : 15.03.2018 Date de dépôt international : 07.09.2017
CIB :
G01N 33/68 (2006.01)
G PHYSIQUE
01
MÉTROLOGIE; ESSAIS
N
RECHERCHE OU ANALYSE DES MATÉRIAUX PAR DÉTERMINATION DE LEURS PROPRIÉTÉS CHIMIQUES OU PHYSIQUES
33
Recherche ou analyse des matériaux par des méthodes spécifiques non couvertes par les groupes G01N1/-G01N31/146
48
Matériau biologique, p.ex. sang, urine; Hémocytomètres
50
Analyse chimique de matériau biologique, p.ex. de sang, d'urine; Recherche ou analyse par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligands; Recherche ou analyse immunologique
68
faisant intervenir des protéines, peptides ou amino-acides
Déposants :
EXPRESSION PATHOLOGY, INC. [US/US]; 9600 Medical Center Drive, Suite 300 Rockville, MD 20850, US
Inventeurs :
HEMBROUGH, Todd; US
CECCHI, Fabiola; US
SCHWARTZ, Sarit; US
Mandataire :
BOOTH, Paul M.; US
BOOTH, Paul, M.; US
DEBOY, Mark; US
EDELL, Ira, C.; US
ALDAG, Andrew, J.; US
Données relatives à la priorité :
62/384,20207.09.2016US
62/402,98430.09.2016US
Titre (EN) SRM/MRM ASSAY FOR THE TUBULIN BETA-3 CHAIN (TUBB3) PROTEIN
(FR) DOSAGE SRM/MRM POUR LA PROTÉINE DE LA CHAÎNE BÊTA -3 DE LA TUBULINE (TUBB3)
Abrégé :
(EN) The current disclosure provides for a specific peptide, and derived ionization characteristics of a peptide from the tubulin beta-3 chain protein (TUBB3) that is particularly advantageous for quantifying the TUBB3 protein directly in biological samples that have been fixed in formalin by the method of Selected Reaction Monitoring (SRM) mass spectrometry. A protein sample is prepared from a biological sample using the Liquid Tissue reagents and protocol and the TUBB3 protein is quantitated by SRM/MRM mass spectrometry analysis of the sample, where the specific peptide is quantitated. Methods of treatment are provided in which the measured level of TUBB3 in a patient tumor sample is compared with a reference level and the patient is treated with a taxane-based treatment regimen when the measured TUBB3 level is lower than the reference level. A suitable reference level is, for example, about 700 amol/μg tissue.
(FR) La présente invention concerne un peptide spécifique, et des caractéristiques d'ionisation dérivées d'un peptide à partir de la protéine de la chaîne bêta-3 de tubuline (TUBB3) qui est particulièrement avantageux pour quantifier la protéine TUBB3 directement dans des échantillons biologiques qui ont été fixés dans la formaline par le procédé de spectrométrie de masse en mode surveillance de réaction sélectionnée (SRM). Un échantillon de protéine est préparé à partir d'un échantillon biologique au moyen de réactifs et du protocole de tissu liquide et la protéine TUBB3 est quantifiée par analyse par spectrométrie de masse en mode SRM/MRM (surveillance de réaction sélectionnée/surveillance de réactions multiples) de l'échantillon, où le peptide spécifique est quantifié. L'invention concerne des procédés de traitement lors desquels le niveau mesuré de TUBB3 dans un échantillon de tumeur de patient est comparé à un niveau de référence et le patient est traité avec un régime de traitement à base de taxane lorsque le niveau de TUBB3 mesuré est inférieur au niveau de référence. Un niveau de référence approprié est, par exemple, environ 700 amol/μg de tissu.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)