Certains contenus de cette application ne sont pas disponibles pour le moment.
Si cette situation persiste, veuillez nous contacter àObservations et contact
1. (WO2018046766) POLYWEB D'ANALYSE DE DONNÉES DE SÉQUENÇAGE HAUT DEBIT
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international    Formuler une observation

N° de publication : WO/2018/046766 N° de la demande internationale : PCT/EP2017/072924
Date de publication : 15.03.2018 Date de dépôt international : 12.09.2017
CIB :
G06F 19/22 (2011.01)
G PHYSIQUE
06
CALCUL; COMPTAGE
F
TRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19
Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10
Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
22
pour la comparaison de séquences impliquant des nucléotides ou des acides aminés, p.ex. recherche d'homologie, identification de motifs ou de SNP [polymorphismes de nucléotides simples] ou alignement de séquences
Déposants :
UNIVERSITE PARIS DESCARTES [FR/FR]; 12 rue de l'Ecole de médecine 75270 Paris Cedex 06, FR
IMAGINE INSTITUT DES MALADIES GENETIQUES NECKER ENFANTS MALADES [FR/FR]; 24 Boulevard du Montparnasse 75015 Paris, FR
Inventeurs :
NITSCHKE, Patrick; FR
Mandataire :
DENNEMEYER & ASSOCIATES S.A.; P.O. Box 700425 81304 München, DE
Données relatives à la priorité :
FR167050612.09.2016FR
Titre (EN) POLYWEB FOR HIGH THROUGHPUT SEQUENCING DATA ANALYSIS
(FR) POLYWEB D'ANALYSE DE DONNÉES DE SÉQUENÇAGE HAUT DEBIT
Abrégé :
(EN) A method for processing data from a high throughput sequencing for processing/analysing nucleic acid sequences corresponding to the exome or to the genome of a plurality of biological samples, in order to find, among said nucleic acid sequences, at least one gene that is possibly involved in a phenotype of interest, from variants Vj in a given chromosome, j taking the values from 1 to T, T being equal to the total number of variants detected in the chromosome, wherein in order to carry out the queries on the variants Vj, bit vectors are calculated, the bits being used to note the membership of these variants Vj to annotation categories in such a way as to allow logical operations between the categories, the membership of these variants Vj being indexed by the genomic position of the variants Vj.
(FR) Procédé de traitement de données issues d'un séquençage haut débit pour traiter/analyser les séquences d'acides nucléiques correspondant à l'exome ou au génome de plusieurs échantillons biologiques, afin de trouver, parmi les dites séquences d'acides nucléiques, au moins un gène possiblement impliqué dans un phénotype d'intérêt, à partir des variants Vj dans un chromosome donné, j prenant les valeurs de 1 à T, T étant égal au nombre total de variants détectés dans le chromosome, dans lequel pour réaliser des requêtes sur les variants Vj, on calcule des vecteurs de bits, les bits étant utilisés pour noter l'appartenance de ces variants Vj à des catégories d'annotation de façon à permettre des opérations logiques entre les catégories, l'appartenance de ces variants Vj étant indexée par la position génomique des variants Vj.
front page image
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : français (FR)
Langue de dépôt : français (FR)