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1. (WO2018040961) MÉTHODE DE CONSTRUCTION D'UNE BIBLIOTHÈQUE ET MÉTHODE DE TYPAGE DE SNP
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N° de publication :    WO/2018/040961    N° de la demande internationale :    PCT/CN2017/098213
Date de publication : 08.03.2018 Date de dépôt international : 21.08.2017
CIB :
C12Q 1/68 (2006.01)
Déposants : GUANGZHOU CONSIDERIN GENE & HEALTH TECHNOLOGY CO., LTD [CN/CN]; 6F, Laboratory Building,grandhop Science and Technology Park No.12 Yuyan Road, Luogang District Guangzhou, Guangdong 510000 (CN)
Inventeurs : SHENG, Sitong; (CN).
HUANG, Siqiang; (CN).
WEI, Ming; (CN)
Données relatives à la priorité :
201610773096.4 30.08.2016 CN
Titre (EN) METHOD FOR BUILDING LIBRARY AND METHOD FOR SNP TYPING
(FR) MÉTHODE DE CONSTRUCTION D'UNE BIBLIOTHÈQUE ET MÉTHODE DE TYPAGE DE SNP
(ZH) 一种建库方法及SNP分型方法
Abrégé : front page image
(EN)Provided is a method for building a library, which comprises: A. performing PCR amplification on a sample to be sequenced containing a SNP site to be detected using a specific amplification primer set to obtain an amplification product; at least one primer in the primer set contains an IIS type restriction enzyme recognition sequence, and the amplification product contains an IIS type restriction enzyme cleavage site, and the distance between the IIS type restriction enzyme cleavage site and the SNP site to be detected is 0 to 5 bases; B. using the IIS type restriction enzyme to cleave the amplification product to obtain a first nucleic acid fragment containing the SNP site to be detected, and forming a first end by enzyme cleaving the first nucleic acid fragment; and C. ligating the first nucleic acid fragment with a sequencing linker at the first end under a ligase to obtain a library molecule. Also provided is a method for SNP typing. The method shortens the detection time for sites, improves the accuracy of the detection, and unifies the sequencing primers for detecting multiple sites in the same system.
(FR)L'invention concerne une méthode de construction d'une bibliothèque consistant à : A. amplifier par PCR un échantillon à séquencer contenant un site SNP à détecter en utilisant un jeu d'amorces d'amplification spécifique pour obtenir un produit d'amplification ; au moins une amorce du jeu d'amorces contient une séquence de reconnaissance d'enzyme de restriction de type IIS et le produit d'amplification contient un site de clivage d'enzyme de restriction de type IIS, et la distance entre le site de clivage d'enzyme de restriction de type IIS et le site SNP à détecter est de 0 à 5 bases ; B. utiliser l'enzyme de restriction de type IIS pour cliver le produit d'amplification pour obtenir un premier fragment d'acide nucléique contenant le site SNP à détecter, et former une première extrémité par clivage enzymatique du premier fragment d'acide nucléique ; et C. ligaturer le premier fragment d'acide nucléique avec un lieur de séquençage au niveau de la première extrémité du premier fragment sous une ligase pour obtenir une molécule de bibliothèque. L'invention concerne également une méthode de typage de SNP. La méthode réduit le délai de détection de certains sites, améliore la précision de la détection, et unifie les amorces de séquençage pour détecter de multiples sites dans le même système.
(ZH)提供了一种建库方法,包括:A、利用特异性扩增引物组对含待测SNP位点的待测序样本进行PCR扩增,得到扩增产物;所述引物组中的至少一种引物上含有IIS型限制性内切酶识别序列,所述扩增产物上含有IIS型限制性内切酶切割位点,所述IIS型限制性内切酶切割位点与所述待测SNP位点之间的距离为0至5个碱基;B、采用IIS型限制性内切酶对扩增产物进行酶切,得到含有待测SNP位点的第一核酸片段,且所述第一核酸片段上经酶切形成第一末端;C、在连接酶作用下,所述第一核酸片段在第一末端处连接测序接头,得到文库分子。还提供了一种SNP分型方法。所述方法缩短了位点检测时间,提高了检测的准确性,且统一了同一体系中进行多个位点检测的测序引物。
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : chinois (ZH)
Langue de dépôt : chinois (ZH)