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1. (WO2018039643) TESTS PAR AMPLIFICATION D'ACIDES NUCLÉIQUES POUR LA DÉTECTION D'AGENTS PATHOGÈNES
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N° de publication : WO/2018/039643 N° de la demande internationale : PCT/US2017/048749
Date de publication : 01.03.2018 Date de dépôt international : 25.08.2017
CIB :
C12Q 1/68 (2018.01) ,C12Q 1/70 (2006.01) ,C40B 40/06 (2006.01) ,G06F 19/22 (2011.01)
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
12
BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
Q
PROCÉDÉS DE MESURE, DE RECHERCHE OU D'ANALYSE FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1
Procédés de mesure, de recherche ou d'analyse faisant intervenir des enzymes ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68
faisant intervenir des acides nucléiques
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
12
BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
Q
PROCÉDÉS DE MESURE, DE RECHERCHE OU D'ANALYSE FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1
Procédés de mesure, de recherche ou d'analyse faisant intervenir des enzymes ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
70
faisant intervenir des virus ou des bactériophages
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
40
TECHNOLOGIE COMBINATOIRE
B
CHIMIE COMBINATOIRE; BIBLIOTHÈQUES, p.ex. CHIMIOTHÈQUES, BIBLIOTHÈQUES VIRTUELLES (IN SILICO)
40
Bibliothèques en soi, p.ex. matrices, mélanges
04
Bibliothèques comprenant uniquement des composés organiques
06
Bibliothèques comprenant des nucléotides ou des polynucléotides ou leurs dérivés
G PHYSIQUE
06
CALCUL; COMPTAGE
F
TRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19
Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10
Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
22
pour la comparaison de séquences impliquant des nucléotides ou des acides aminés, p.ex. recherche d'homologie, identification de motifs ou de SNP [polymorphismes de nucléotides simples] ou alignement de séquences
Déposants : SABETI, Pardis[US/US]; US
BANIECKI, Mary, Lynn[US/US]; US
THE BROAD INSTITUTE, INC.[US/US]; 415 Main Street Cambridge, MA 02142, US
MASSACHUSETTS INSTITUTE OF TECHNOLOGY[US/US]; 77 Massachusetts Avenue Cambridge, MA 02139, US
PRESIDENT AND FELLOWS OF HARVARD COLLEGE[US/US]; 17 Quincy Street Cambridge, MA 02138, US
Inventeurs : SABETI, Pardis; US
BANIECKI, Mary, Lynn; US
METSKY, Hayden; US
Mandataire : NIX, F., Brent; US
Données relatives à la priorité :
62/380,35226.08.2016US
62/459,57815.02.2017US
62/507,61917.05.2017US
Titre (EN) NUCLEIC ACID AMPLIFICATION ASSAYS FOR DETECTION OF PATHOGENS
(FR) TESTS PAR AMPLIFICATION D'ACIDES NUCLÉIQUES POUR LA DÉTECTION D'AGENTS PATHOGÈNES
Abrégé :
(EN) The present invention relates to a method for generating primers and/or probes for use in analyzing a sample which may comprise a pathogen target sequence comprising providing a set of input genomic sequence to one or more target pathogens, generating a set of target sequences from the set of input genomic sequences, identifying one or more highly conserved target sequences, and generating one or more primers, one or more probes, or a primer pair and probe combination based on the one or more conserved target sequences.
(FR) La présente invention concerne une méthode de génération d'amorces et/ou de sondes à utiliser dans l'analyse d'un échantillon pouvant comporter une séquence cible d'agent pathogène, qui comprenant les étapes consistant : à fournir un ensemble de séquences génomiques d'entrée correspondant à un ou plusieurs agents pathogènes cibles, à générer un ensemble de séquences cibles à partir de l'ensemble de séquences génomiques d'entrée, à identifier une ou plusieurs séquences cibles hautement conservées, et à générer une ou plusieurs amorces, une ou plusieurs sondes, ou une paire d'amorces et une combinaison de sondes sur la base de la ou des séquences cibles conservées.
front page image
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)