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1. (WO2018034745) APPEL DE BASES DE SÉQUENÇAGE PAR NANOPORES

Pub. No.:    WO/2018/034745    International Application No.:    PCT/US2017/041395
Publication Date: Fri Feb 23 00:59:59 CET 2018 International Filing Date: Tue Jul 11 01:59:59 CEST 2017
IPC: C12Q 1/68
G06F 19/18
G06F 19/22
G01N 33/487
Applicants: THE REGENTS OF THE UNIVERSITY OF CALIFORNIA
Inventors: STOIBER, Marcus
BROWN, James
Title: APPEL DE BASES DE SÉQUENÇAGE PAR NANOPORES
Abstract:
La présente invention concerne des systèmes et des procédés d'appel de bases de séquençage par nanopores. Dans un mode de réalisation, le procédé peut consister à : recevoir des données brutes de séquençage par nanopores, comprenant une pluralité de valeurs d'acquisition de données continues (DAC) correspondant à une biomolécule ; normaliser les données brutes de séquençage par nanopores pour générer des données normalisées de séquençage par nanopores comprenant une pluralité de valeurs DAC normalisées ; générer, à l'aide d'un premier réseau neuronal (NN) et d'une valeur DAC normalisée parmi la pluralité de valeurs DAC normalisées, un vecteur de valeurs de probabilité transformées, ce qui segmente la pluralité de valeurs DAC normalisées en une pluralité d'événements discrets ; générer, à l'aide d'un deuxième réseau neuronal et du vecteur d'événements, une détermination d'élément de la biomolécule.