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1. (WO2017215517) PROCÉDÉ D'ÉLIMINATION DE SOUS-PRODUITS DE CONNEXION DE LIEUR 5' ET 3' DANS LA CONSTRUCTION D'UNE BIBLIOTHÈQUE DE SÉQUENÇAGE
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N° de publication :    WO/2017/215517    N° de la demande internationale :    PCT/CN2017/087678
Date de publication : 21.12.2017 Date de dépôt international : 09.06.2017
CIB :
C12N 15/10 (2006.01), C12P 19/34 (2006.01), C40B 50/06 (2006.01), C12Q 1/68 (2006.01)
Déposants : SHANGHAI INSTITUTES FOR BIOLOGICAL SCIENCES, CHINESE ACADEMY OF SCIENCES [CN/CN]; 319 YUE YANG ROAD Shanghai 200031 (CN)
Inventeurs : WU, Ligang; (CN).
YANG, Qiyuan; (CN)
Mandataire : SHANGHAI PATENT & TRADEMARK LAW OFFICE, LLC; 435 Guiping Road Shanghai 200233 (CN)
Données relatives à la priorité :
201610406827.1 12.06.2016 CN
Titre (EN) METHOD FOR REMOVING 5' AND 3' LINKER CONNECTION BY-PRODUCTS IN SEQUENCING LIBRARY CONSTRUCTION
(FR) PROCÉDÉ D'ÉLIMINATION DE SOUS-PRODUITS DE CONNEXION DE LIEUR 5' ET 3' DANS LA CONSTRUCTION D'UNE BIBLIOTHÈQUE DE SÉQUENÇAGE
(ZH) 测序文库构建中5'和3'接头连接副产物的去除方法
Abrégé : front page image
(EN)Disclosed is a method for removing 5'and 3' linker connection by-products in a construction based on a sequencing library. In particular, provided is a method for cleaving an RNA-DNA : cDNA hybrid duplex, comprising the step of mixing a Cas enzyme, an sgRNA and the RNA-DNA : cDNA hybrid duplex, wherein the DNA moiety in the hybrid duplex comprises a protospacer-adjacent motif (PAM sequence) recognized by the Cas enzyme; the sgRNA can specifically bind to a portion of the cDNA strand; and the Cas enzyme can specifically recognize the sgRNA and cleave the hybrid duplex; optionally, the RNA-DNA : cDNA hybrid duplex is generated during the construction of the RNA sequencing library; and optionally, the RNA is the 5' linker used during the construction of the RNA sequencing library, and the DNA is the 3' linker used during the construction of the RNA sequencing library.
(FR)L'invention concerne un procédé d'élimination de sous-produits de connexion de lieur 5' et 3' dans la construction d'une bibliothèque de séquençage. L'invention concerne en particulier un procédé de clivage d'un duplex hybride ARN-ADN : ADNc, comprenant l'étape consistant à mélanger une enzyme Cas, un ARNsg et le duplex hybride ARN-ADN : ADNc, la fraction ADN dans le duplex hybride comprenant un motif adjacent à un proto-espaceur (séquence PAM) reconnu par l'enzyme Cas ; l'ARNsg peut se lier spécifiquement à une partie du brin d'ADNc ; et l'enzyme Cas peut reconnaître spécifiquement l'ARNsg et cliver le duplex hybride ; éventuellement le duplex hybride ARN-ADN : ADNc est généré pendant la construction de la bibliothèque de séquençage d'ARN ; et éventuellement, l'ARN est le lieur 5' utilisé pendant la construction de la bibliothèque de séquençage d'ARN, et l'ADN est le lieur 3' utilisé pendant la construction de la bibliothèque de séquençage d'ARN.
(ZH)基于测序文库构建中5'和3'接头连接副产物的去除方法。具体而言,提供一种切割RNA-DNA:cDNA杂交双链体的方法,所述方法包括混合Cas酶、sgRNA和所述RNA-DNA:cDNA杂交双链体的步骤;其中,该杂交双链体中的DNA部分包含该Cas酶识别的前间区序列邻近基序(PAM序列);该sgRNA能特异性结合该cDNA链的一部分;和该Cas酶能特异性识别该sgRNA,并切割所述杂交双链体;任选地,所述RNA-DNA:cDNA杂交双链体产生于RNA测序文库的构建过程中;以及任选地,所述RNA为RNA测序文库构建过程中使用的5'接头,所述DNA为RNA测序文库构建过程中使用的3'接头。
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : chinois (ZH)
Langue de dépôt : chinois (ZH)