Recherche dans les collections de brevets nationales et internationales

1. (WO2017214765) PROCÉDÉ ET SYSTÈME DE COMPRESSION SANS PERTE À STOCKAGE RAPIDE À FILS MULTIPLES POUR DONNÉES FASTQ

Pub. No.:    WO/2017/214765    International Application No.:    PCT/CN2016/085426
Publication Date: Fri Dec 22 00:59:59 CET 2017 International Filing Date: Mon Jun 13 01:59:59 CEST 2016
IPC: H03M 7/30
G06F 19/10
Applicants: SHENZHEN UNIVERSITY
深圳大学
Inventors: ZHU, Zexuan
朱泽轩
HUANG, Zhian
黄志安
SUN, Yiwen
孙怡雯
WEN, Zhenkun
文振焜
Title: PROCÉDÉ ET SYSTÈME DE COMPRESSION SANS PERTE À STOCKAGE RAPIDE À FILS MULTIPLES POUR DONNÉES FASTQ
Abstract:
L'invention concerne un procédé de compression sans perte à stockage rapide à fils multiples pour des données FASTQ, qui est appliqué à la compression d'une séquence d'ADN. Le procédé comprend : une étape de classification de données consistant à entrer des données FASTQ originales, et à diviser une lecture courte des données FASTQ originales en trois flux de données, à savoir des métadonnées, une fraction de masse et une séquence de bases (S11) ; une étape de compression de données comme suit : pour les métadonnées, utiliser un codage incrémentiel pour détecter et éliminer des informations redondantes des métadonnées ; pour la fraction de masse, utiliser un modèle de prédiction PPM au niveau du bit et un codage arithmétique pour la compression ; et pour la séquence de bases, utiliser un codage arithmétique amélioré d'ordre fixe pour la compression (S12) ; et une étape de sortie de données consistant à archiver et à fusionner des résultats de compression de différents flux de données, et à fournir en sortie des données finales après la compression (S13). La solution peut améliorer l'efficacité de compression et la vitesse de compression.