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1. (WO2017214320) SYSTÈMES, APPAREILS ET PROCÉDÉS BIOINFORMATIQUES POUR EFFECTUER UN TRAITEMENT SECONDAIRE ET/OU TERTIAIRE

Pub. No.:    WO/2017/214320    International Application No.:    PCT/US2017/036424
Publication Date: Fri Dec 15 00:59:59 CET 2017 International Filing Date: Thu Jun 08 01:59:59 CEST 2017
IPC: G06F 19/28
Applicants: ILLUMINA, INC.
Inventors: VAN ROOYEN, Pieter
RUEHLE, Michael
MEHIO, Rami
STONE, Gavin
HAHM, Mark
OJARD, Eric
PTASHEK, Amnon
Title: SYSTÈMES, APPAREILS ET PROCÉDÉS BIOINFORMATIQUES POUR EFFECTUER UN TRAITEMENT SECONDAIRE ET/OU TERTIAIRE
Abstract:
L'invention concerne un système, un procédé et un appareil pour exécuter une analyse bioinformatique sur des données de séquence génétique. L'invention concerne plus particulièrement une plate-forme d'analyse génomique destinée à executer un pipeline d'analyse de séquence. La plate-forme d'analyse génomique comprend un ou plusieurs d'un premier circuit intégré, chaque premier circuit intégré formant une unité centrale de traitement (CPU) qui réagit à un ou plusieurs algorithmes logiciels qui sont configurés pour ordonner à la CPU de réaliser un premier ensemble d'étapes de traitement génomique du pipeline d'analyse de séquence. Un deuxième circuit intégré est également présent, chaque deuxième circuit intégré formant un réseau prédiffusé programmable par l'utilisateur (FPGA), le FPGA étant configuré par un microprogramme pour amener un ensemble de circuits logiques numériques câblés physiquement, lesquels sont interconnectés par une pluralité d'interconnexions physiques, à effectuer un deuxième ensemble d'étapes de traitement génomique du pipeline d'analyse de séquence. L'ensemble de circuits logiques numériques câblés physiquement de chaque FPGA est agencé sous la forme d'un ensemble de moteurs de traitement pour effectuer le deuxième ensemble d'étapes de traitement génomiques. L'invention concerne également une mémoire partagée.