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1. (WO2017210603) GÉNOTYPAGE DE LOCI POLYPLOÏDES

Pub. No.:    WO/2017/210603    International Application No.:    PCT/US2017/035751
Publication Date: Fri Dec 08 00:59:59 CET 2017 International Filing Date: Sat Jun 03 01:59:59 CEST 2017
IPC: G06F 19/18
G06F 19/24
Applicants: ILLUMINA, INC.
Inventors: KELLEY, Ryan
Title: GÉNOTYPAGE DE LOCI POLYPLOÏDES
Abstract:
L'invention concerne des procédés, des systèmes et des produits informatiques permettant de génotyper des organismes polyploïdes, ainsi que des organismes diploïdes. Les procédés décrits utilisent un modèle d'intensité d'allèle pour générer des définitions de groupes. Le modèle d'intensité d'allèle concerne des comptes d'allèles de différents génotypes à des intensités de signaux générées par la plate-forme de génotypage. Le modèle comprend également une capacité de mise à jour des positions de groupes obtenues à partir d'un modèle de probabilité maximal à l'aide d'un procédé bayésien.