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1. (WO2017210456) SYSTÈMES, DISPOSITIFS ET PROCÉDÉS D'ANALYSE ET DE STOCKAGE AMÉLIORÉS DE DONNÉES GÉNOTYPIQUES ET PHÉNOTYPIQUES
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international    Formuler une observation

N° de publication :    WO/2017/210456    N° de la demande internationale :    PCT/US2017/035496
Date de publication : 07.12.2017 Date de dépôt international : 01.06.2017
CIB :
G06F 19/18 (2011.01), G06F 19/24 (2011.01)
Déposants : LINEAGEN, INC. [US/US]; 2677 E. Parleys Way Salt Lake City, Utah 84109 (US)
Inventeurs : VENKATASUBRAMANIAN, Suresh; (US).
HO, Karen S.; (US)
Mandataire : SUD, Dhruv; (US).
TUSCAN, Michael S.; (US)
Données relatives à la priorité :
62/344,131 01.06.2016 US
62/410,261 19.10.2016 US
Titre (EN) SYSTEMS, DEVICES AND METHODS FOR IMPROVED ANALYSIS AND STORAGE OF GENOTYPIC AND PHENOTYPIC DATA
(FR) SYSTÈMES, DISPOSITIFS ET PROCÉDÉS D'ANALYSE ET DE STOCKAGE AMÉLIORÉS DE DONNÉES GÉNOTYPIQUES ET PHÉNOTYPIQUES
Abrégé : front page image
(EN)An apparatus includes a database storing: a set of sequences, each associated with a different individual; location information for each region from a set of regions; and for each individual, a characteristic. The apparatus also includes a processor for generating, for each region, a first element matrix for a first element at a first element location in each sequence. The processor also generates a region matrix based on the first element matrix and estimates a first correlation between the region matrix and the characteristic. The processor also generates a second element matrix for a second element at a second element location in each sequence, and updates the region matrix based on the second element matrix to define an updated region matrix. The processor also estimates a second correlation between the updated region matrix and the characteristic, and classifies an individual based on the first correlation and/or the second correlation.
(FR)L'invention concerne un appareil contenant une base de données qui stocke : un ensemble de séquences, chacune associée à un individu différent ; des informations d'emplacement pour chaque région parmi un ensemble de régions ; et une caractéristique pour chaque individu. L'appareil comprend également un processeur destiné à générer, pour chaque région, une première matrice d'éléments pour un premier élément à un premier emplacement d'élément dans chaque séquence. Le processeur génère également une matrice de région sur la base de la première matrice d'éléments et estime une première corrélation entre la matrice de région et la caractéristique. Le processeur génère également une deuxième matrice d'éléments pour un deuxième élément à un deuxième emplacement d'élément dans chaque séquence, et met à jour la matrice de région sur la base de la deuxième matrice d'éléments afin de définir une matrice de région mise à jour. Le processeur estime également une deuxième corrélation entre la matrice de région mise à jour et la caractéristique, et classifie un individu sur la base de la première corrélation et/ou de la deuxième corrélation.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)