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1. (WO2017209575) ÉVALUATION DE LA SPÉCIFICITÉ D'OLIGONUCLÉOTIDES
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N° de publication :    WO/2017/209575    N° de la demande internationale :    PCT/KR2017/005818
Date de publication : 07.12.2017 Date de dépôt international : 02.06.2017
CIB :
G06F 19/22 (2011.01), G06F 19/28 (2011.01), C12Q 1/68 (2006.01)
Déposants : SEEGENE, INC. [KR/KR]; 8FL., 9FL., 91, Ogeum-ro Songpa-gu Seoul 05548 (KR)
Inventeurs : CHUN, Jong Yoon; (KR).
YOON, Gi-Seok; (KR)
Mandataire : YOON, Dae Woong; (KR)
Données relatives à la priorité :
10-2016-0069487 03.06.2016 KR
Titre (EN) EVALUATION OF SPECIFICITY OF OLIGONUCLEOTIDES
(FR) ÉVALUATION DE LA SPÉCIFICITÉ D'OLIGONUCLÉOTIDES
Abrégé : front page image
(EN)The present invention relates to a method for evaluating specificity of oligonucleotides represented by 5'-X-Y-Z-3'. The present invention comprises comparing the complete or a partial sequence of the oligonucleotide of Formula (I) against at least one database of nucleotide sequences, and extracting reference nucleotide sequences comprising a region homologous to the complete or a partial sequence of the oligonucleotide of Formula (I) from the database; and analyzing portion-by-portion match/mismatch between the oligonucleotide of Formula (I) and each of the reference nucleotide sequences to provide (i) the number or ratio of matched or mismatched bases between the portion X of the oligonucleotide of Formula (I) and each of the reference nucleotide sequences and individually (ii) the number or ratio of matched or mismatched bases between the portion Z of the oligonucleotide of Formula (I) and each of the reference nucleotide sequences.
(FR)La présente invention concerne un procédé d'évaluation de la spécificité d'oligonucléotides représentés par 5'-X-Y-Z-3'. La présente invention consiste à comparer la séquence complète ou partielle de l'oligonucléotide de formule (I) à au moins une base de données de séquences de nucléotides, et à extraire des séquences de nucléotides de référence comprenant une région homologue à la séquence complète ou partielle de l'oligonucléotide de formule (I) à partir de la base de données ; et à analyser un appariement/mésappariement partie après partie entre l'oligonucléotide de formule (I) et chaque séquence de nucléotides de référence afin de fournir (i) le nombre ou le rapport de bases appariées ou mésappariées entre la partie X de l'oligonucléotide de formule (I) et chaque séquence de nucléotides de référence et individuellement (ii) le nombre ou le rapport de bases appariées ou mésappariées entre la partie Z de l'oligonucléotide de formule (I) et chaque séquence de nucléotides de référence.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)