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1. (WO2017178441) PROCÉDÉ D'OPTIMISATION ET DE CRIBLAGE DE BIOMOLÉCULES POUR L'OPTIMISATION ET LE CRIBLAGE DE BIOMOLÉCULES ACTIVES BIOLOGIQUES ET DE GRANDE TAILLE, ET SYSTÈME ASSOCIÉ
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N° de publication :    WO/2017/178441    N° de la demande internationale :    PCT/EP2017/058579
Date de publication : 19.10.2017 Date de dépôt international : 10.04.2017
CIB :
G06F 19/00 (2011.01)
Déposants : TECHNISCHE UNIVERSITÄT HAMBURG-HARBURG [DE/DE]; Am Schwarzenberg-Campus 1 21073 Hamburg (DE)
Inventeurs : JANDT, Uwe; (DE).
ZENG, An-Ping; (DE)
Mandataire : SCHMELCHER, Thilo; (DE)
Données relatives à la priorité :
93025 13.04.2016 LU
Titre (EN) A BIO-MOLECULE OPTIMIZATION AND SCREENING METHOD FOR OPTIMIZING AND SCREENING LARGE AND BIOLOGICAL ACTIVE BIO-MOLECULES AND SYSTEM THEREFOR
(FR) PROCÉDÉ D'OPTIMISATION ET DE CRIBLAGE DE BIOMOLÉCULES POUR L'OPTIMISATION ET LE CRIBLAGE DE BIOMOLÉCULES ACTIVES BIOLOGIQUES ET DE GRANDE TAILLE, ET SYSTÈME ASSOCIÉ
Abrégé : front page image
(EN)The invention relates to a bio-molecule optimization and screening method for optimizing screening large and biological active bio-molecules, whereby a large Bio-molecule comprises a weight equal or above 2 KDa, whereby a set of reproducible isolated reaction compartments are provided (S1), each compartment comprising one or more biochemical precursors to conduct the steps of: a) controlled manipulating (S2) of the set of isolated reaction compartments leading to respective bio-molecules within the respective compartments, b) inducing expression (S3) of the manipulated bio-molecules derived by the controlled manipulation, c) inducing test reactions (S4) with respect to the expressions, d) measuring one or more measurement parameters (S6) relating to the test reactions, e) performing steps a) to d) again, whereby at least one out of a plurality of parameters of the manipulation in step a is changed (S7) based on the measured parameters of step d) and based on at least one focused library and a mathematical optimization allowing for sub-exponential scaling with respect to a plurality of parameters, whereby link between previously chosen parameters of a repeated performance of step a) and corresponding measurement parameters determined by repeated performance of step s b) to d) is continuously reconstructed based on previous accumulated measurement results and suitable analysis based on at one focused library and a mathematical optimization. The invention also pertains to a system adapted to perform the method.
(FR)L'invention concerne un procédé d'optimisation et de criblage de biomolécules permettant d'optimiser le criblage de biomolécules actives biologiques et de grande taille, une molécule biologique de grande taille étant une molécule ayant un poids égal ou supérieur à 2 KDa, un ensemble de compartiments réactionnels isolés reproductibles étant prévu (S1), chaque compartiment comprenant un ou plusieurs précurseurs biochimiques pour effectuer les étapes consistant à : a) manipuler de manière contrôlée (S2) l'ensemble de compartiments réactionnels isolés conduisant à des biomolécules respectives à l'intérieur des compartiments respectifs, b) induire l'expression (S3) des biomolécules manipulées dérivées de la manipulation contrôlée, c) induire des réactions d'analyse (S4) par rapport aux expressions, d) mesurer un ou plusieurs paramètres de mesure (S6) en relation avec les réactions d'analyse, e) répéter les étapes a) à d), au moins un paramètre parmi une pluralité de paramètres de la manipulation à l'étape a étant modifié (S7) d'après les paramètres mesurés de l'étape d) et d'après au moins une bibliothèque focalisée et une optimisation mathématique permettant une mise à l'échelle sub-exponentielle par rapport à une pluralité de paramètres, la liaison entre des paramètres précédemment choisis d'une performance répétée de l'étape a) et des paramètres de mesure correspondants déterminés par des performances répétées des étapes b) à d) sont reconstruits en continu d'après les résultats de mesure cumulés précédents et l'analyse appropriée d'après une bibliothèque focalisée et une optimisation mathématique. L'invention concerne également un système conçu pour exécuter le procédé.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)