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1. (WO2017177308) SÉQUENÇAGE DE CAPTURE HYBRIDE POUR DÉTERMINER LA CLONALITÉ DE CELLULES IMMUNITAIRES
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N° de publication :    WO/2017/177308    N° de la demande internationale :    PCT/CA2017/000084
Date de publication : 19.10.2017 Date de dépôt international : 13.04.2017
CIB :
C40B 40/06 (2006.01), C12N 15/10 (2006.01), C12N 15/12 (2006.01), C12N 15/13 (2006.01), C12Q 1/68 (2006.01), C40B 30/04 (2006.01)
Déposants : UNIVERSITY HEALTH NETWORK (UHN) [CA/CA]; 190 Elizabeth Street R. Fraser Elliott Building Room 1S-417 Toronto, Ontario M5G 2C4 (CA)
Inventeurs : PUGH, Trevor John; (CA).
MULDER, David Thomas; (CA).
MAHE, Etienne Raymond G. A.; (CA)
Mandataire : CHIU, Jung-Kay; Norton Rose Fulbright Canada LLP/S.E.N.C.R.L, s.r.l. 1 Place Ville Marie, Suite 2500 Montreal, Quebec H3B 1R1 (CA)
Données relatives à la priorité :
62/322,999 15.04.2016 US
Titre (EN) HYBRID-CAPTURE SEQUENCING FOR DETERMINING IMMUNE CELL CLONALITY
(FR) SÉQUENÇAGE DE CAPTURE HYBRIDE POUR DÉTERMINER LA CLONALITÉ DE CELLULES IMMUNITAIRES
Abrégé : front page image
(EN)In an aspect, there is provided, a method of capturing a population of T-Cell receptor and/or immunoglobulin sequences with variable regions within a patient sample, said method comprising: extracting/preparing DNA fragments from the patient sample; ligating a nucleic acid adapter to the DNA fragments, the nucleic acid adapter suitable for recognition by a pre-selected nucleic acid probe; capturing DNA fragments existing in the patient sample using a collection of nucleic acid hybrid capture probes, wherein each capture probe is designed to hybridize to a known V gene segment and/or a J gene segment within the T cell receptor and/or immunoglobulin genomic loci.
(FR)Sous un aspect, cette invention concerne un procédé de capture d'une population de séquences d'un récepteur de lymphocytes T et/ou d'une immunoglobuline avec des régions variables dans un échantillon provenant d'un patient, ledit procédé comprenant : l'extraction/la préparation de fragments d'ADN à partir de l'échantillon du patient ; la ligature d'un adaptateur d'acide nucléique aux fragments d'ADN, l'adaptateur d'acide nucléique se prêtant à reconnaissance par une sonde d'acide nucléique présélectionnée ; la capture de fragments d'ADN existant dans l'échantillon du patient à l'aide d'un ensemble de sondes de capture hybrides d'acide nucléique, chaque sonde de capture étant conçue pour s'hybrider à un segment de gène V connu et/ou à un segment de gène J à l'intérieur des loci génomiques du récepteur de lymphocyte T et/ou de l'immunoglobuline.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)