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1. (WO2017169736) DISPOSITIF DE TRAITEMENT D'INFORMATIONS ET PROGRAMME
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N° de publication :    WO/2017/169736    N° de la demande internationale :    PCT/JP2017/010169
Date de publication : 05.10.2017 Date de dépôt international : 14.03.2017
CIB :
G06F 19/18 (2011.01), C12M 1/00 (2006.01), C12N 15/09 (2006.01)
Déposants : INTEC INC. [JP/JP]; 5-5, Ushijimashin-machi, Toyama-shi, Toyama 9308577 (JP).
THE UNIVERSITY OF TOKYO [JP/JP]; 3-1, Hongo 7-chome, Bunkyo-ku, Tokyo 1138654 (JP)
Inventeurs : TERAI, Goro; (JP).
ASAI, Kiyoshi; (JP)
Mandataire : SK INTELLECTUAL PROPERTY LAW FIRM; Hiroo-Building 4th Floor, 3-12-40, Hiroo, Shibuya-ku, Tokyo 1500012 (JP).
OKUNO Akihiko; (JP).
ITO Hiroyuki; (JP)
Données relatives à la priorité :
2016-070976 31.03.2016 JP
Titre (EN) INFORMATION PROCESSING DEVICE AND PROGRAM
(FR) DISPOSITIF DE TRAITEMENT D'INFORMATIONS ET PROGRAMME
(JA) 情報処理装置及びプログラム
Abrégé : front page image
(EN)The purpose of the present invention is to provide an information processing device and method capable of increasing the yield of a target protein by suppressing homologous recombination. According to the present invention, the information processing device has: a parent population data acquisition part for acquiring first-generation parent population data representing a first-generation parent population, said parent population data including a predetermined number of individual data generated on the basis of an amino-acid sequence, a number of genes, and data representing a codon frequency table; a mutation treatment part for applying a mutation treatment to the individuals included in the first-generation parent population data; a child population data acquisition part for acquiring first-generation child population data representing a first-generation child population which includes the mutation-treated individuals; a non-dominated sorting execution part for applying non-dominated sorting to first-generation integrated data, which is obtained by combining the first-generation parent population data with the first-generation child population data, on the basis of predetermined evaluation criteria related to codon adaptability and codon base sequences, and classifying all the individual data included in the first-generation integrated data by rank in a Pareto optimal solution; and an individual selection part for selecting a predetermined number of individual data in descending order of rank from all the individual data which have been classified by rank.
(FR)La présente invention a pour objet de fournir un dispositif et un procédé de traitement d'informations qui peuvent augmenter le rendement d'une protéine cible en supprimant une recombinaison homologue. Selon la présente invention, le dispositif de traitement d'informations comporte : une partie d'acquisition de données de population parent destinée à acquérir des données de population parent de première génération représentant une population parent de première génération, lesdites données de population parent comportant un nombre prédéterminé de données individuelles générées sur la base d'une séquence d'acides aminés, un certain nombre de gènes et des données représentant une table de fréquence de codon; une partie de traitement de mutation destinée à appliquer un traitement de mutation aux individus inclus dans les données de population parent de première génération; une partie d'acquisition de données de population enfant destinée à acquérir des données de population enfant de première génération représentant une population enfant de première génération qui comprend les individus traités par mutation; une partie d'exécution de tri non dominé destinée à appliquer un tri non dominé à des données intégrées de première génération, qui sont obtenues par combinaison des données de population parent de première génération avec les données de population enfant de première génération, sur la base de critères d'évaluation prédéterminés associés à l'adaptabilité de codon et des séquences de base de codon, et à classer toutes les données individuelles incluses dans les données intégrées de première génération par rang dans une solution Pareto optimale; et une partie de sélection individuelle destinée à sélectionner un nombre prédéterminé de données individuelles dans un ordre décroissant de rang à partir de toutes les données individuelles qui ont été classées par rang.
(JA)相同組み換えを抑制し、目的タンパク質の生産量を高めることが可能な情報処理装置及びプログラムを提供するものである。 本発明によれば、アミノ酸配列、遺伝子数及びコドン頻度表を表すデータに基いて生成されたデータであって、予め定められた数の個体データを含む第1世代の親個体集団を表す第1世代親個体集団データを取得する親個体集団データ取得部と、前記第1世代親個体集団データに含まれる個体に対し、変異処理を実行する変異処理部と、前記変異処理が実行された個体を含む第1世代の子個体集団を表す第1世代子個体集団データを取得する子個体集団データ取得部と、予め定められた評価基準であって、コドン適合度及び前記コドンの塩基配列に関する評価基準に基いて、前記第1世代親個体集団データ及び前記第1世代子個体集団データを統合した第1世代統合データに対して非優越ソート処理を実行し、前記第1世代統合データに含まれる全個体データをパレート最適解におけるランク毎に分類する非優越ソート実行部と、前記ランク毎に分類された全個体データから、前記ランクの高い順に予め定められた数の前記個体データを選択する個体選択部と、を有する情報処理装置が提供される。
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : japonais (JA)
Langue de dépôt : japonais (JA)