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1. (WO2017145496) PROCÉDÉ D'ANALYSE DE CHAÎNE DE SUCRE DE TYPE SIALYLE
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N° de publication : WO/2017/145496 N° de la demande internationale : PCT/JP2016/086764
Date de publication : 31.08.2017 Date de dépôt international : 09.12.2016
CIB :
G01N 27/62 (2006.01)
Déposants : SHIMADZU CORPORATION[JP/JP]; 1, Nishinokyo-Kuwabara-cho, Nakagyo-ku, Kyoto-shi, Kyoto 6048511, JP
Inventeurs : NISHIKAZE, Takashi; JP
Mandataire : KYOTO INTERNATIONAL PATENT LAW OFFICE; Hougen-Sizyokarasuma Building, 37, Motoakuozi-tyo, Higasinotouin Sizyo-sagaru, Simogyo-ku, Kyoto-si, Kyoto 6008091, JP
Données relatives à la priorité :
2016-03060322.02.2016JP
Titre (EN) METHOD FOR ANALYZING SIALYL SUGAR CHAIN
(FR) PROCÉDÉ D'ANALYSE DE CHAÎNE DE SUCRE DE TYPE SIALYLE
(JA) シアリル糖鎖解析方法
Abrégé : front page image
(EN) The purpose of the present invention is to carry out the analysis of the structure of a sialyl sugar chain, including the mode of the linkage of sialic acid bound to a terminal of a sugar chain, with high efficiency. A sialic acid residue contained in a sample (a sugar chain) of interest is modified in a linkage-mode-specific manner (S2), and subsequently the sample is subjected to mass spectrometry to obtain mass spectra (S3). The monosaccharide composition is estimated in a round-robin manner using the types and the range of number of monosaccharides as conditions on the basis of the mass of a modified sugar chain which is estimated from the m/z value of each of peaks observed on the mass spectra (S4), and subsequently candidates for the monosaccharide composition which are respectively nominated for the peaks are narrowed down using the difference in mass of modified forms produced by linkage-mode-specific modification (S5). More specifically, peaks having difference in mass, which corresponds to the difference in mass of the modified forms produced by linkage-mode-specific modification, are found and are deemed as a group of peaks which is derived from a single sugar chain including a linkage isomer, and the narrowing down is carried out by eliminating candidates which do not meet the conditions, such as the presence or absence of a sialic acid residue modified form or the number of the sialic acid residue modified form, from the candidates for the monosaccharide composition which correspond to the peaks belonging to the above-mentioned group.
(FR) La présente invention vise à réaliser l'analyse de la structure d'une chaîne de sucre de type sialyle, comprenant le mode de la liaison de l'acide sialique lié à une extrémité d'une chaîne de sucre, avec un rendement élevé. Un résidu d'acide sialique contenu dans un échantillon (une chaîne de sucre) d'intérêt est modifié d'une manière spécifique au mode de liaison (S2), et l'échantillon est ensuite soumis à une spectrométrie de masse pour obtenir des spectres de masse (S3). La composition monosaccharidique est estimée selon un test comparatif inter-laboratoires à l'aide des types et de la plage de nombre de monosaccharides comme conditions sur la base de la masse d'une chaîne de sucre modifiée qui est estimée à partir de la valeur m/z de chacun des pics observés sur les spectres de masse (S4), puis des candidats pour la composition monosaccharidique qui sont respectivement désignés pour les pics sont restreints en utilisant la différence de masse de formes modifiées produites par modification spécifique au mode de liaison (S5). Plus spécifiquement, des pics ayant une différence de masse, qui correspond à la différence de masse des formes modifiées produites par modification spécifique au mode de liaison, sont identifiés et sont considérés comme un groupe de pics qui est dérivé d'une chaîne de sucre unique comprenant un isomère de liaison, et la restriction est effectuée en éliminant des candidats qui ne satisfont pas les conditions, telles que la présence ou l'absence d'une forme modifiée de résidu d'acide sialique ou le nombre de la forme modifiée de résidu d'acide sialique, parmi les candidats pour la composition monosaccharidique qui correspondent aux pics appartenant au groupe susmentionné.
(JA) 糖鎖の末端に結合したシアル酸の結合様式を含めたシアリル糖鎖の構造解析を効率良く行う。 解析対象の試料(糖鎖)に含まれるシアル酸残基を結合様式特異的に修飾したあと(S2)、該試料を質量分析してマススペクトルを取得する(S3)。マススペクトル上で観測される各ピークのm/z値から推定される修飾糖鎖の質量に基づき、単糖の種類と個数範囲を条件とした総当たり的な単糖組成の推定を行い(S4)、各ピークに対し挙げられた単糖組成候補を結合様式特異的修飾による修飾体の質量差を利用して絞り込む(S5)。具体的には、結合様式特異的修飾による修飾体の質量差に相当する質量差を有するピークを見つけて結合異性体を含む同一糖鎖由来の一群のピークとみなし、それに属するピークに対応する単糖組成候補について、シアル酸残基修飾体の有無や個数等の条件を満たさない候補を除外することで絞り込みを行う。
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
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Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : japonais (JA)
Langue de dépôt : japonais (JA)