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1. (WO2017139690) ANALYSE DE POPULATION CELLULAIRE UTILISANT DES POLYMORPHISMES DE NUCLÉOTIDE SIMPLE À PARTIR DE TRANSCRIPTOMES MONOCELLULAIRES
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N° de publication : WO/2017/139690 N° de la demande internationale : PCT/US2017/017544
Date de publication : 17.08.2017 Date de dépôt international : 10.02.2017
CIB :
C12N 15/10 (2006.01) ,C40B 30/06 (2006.01) ,C12Q 1/68 (2006.01) ,G06F 19/20 (2011.01) ,G06F 19/22 (2011.01) ,G01N 1/28 (2006.01)
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
12
BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
N
MICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
15
Techniques de mutation ou génie génétique; ADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p.ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purification; Utilisation d'hôtes pour ceux-ci
09
Technologie d'ADN recombinant
10
Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
40
TECHNOLOGIE COMBINATOIRE
B
CHIMIE COMBINATOIRE; BIBLIOTHÈQUES, p.ex. CHIMIOTHÈQUES, BIBLIOTHÈQUES VIRTUELLES (IN SILICO)
30
Procédés de criblage des bibliothèques
06
en mesurant les effets sur des cellules, des tissus ou des organismes vivants
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
12
BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
Q
PROCÉDÉS DE MESURE, DE RECHERCHE OU D'ANALYSE FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1
Procédés de mesure, de recherche ou d'analyse faisant intervenir des enzymes ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68
faisant intervenir des acides nucléiques
G PHYSIQUE
06
CALCUL; COMPTAGE
F
TRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19
Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10
Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
20
pour l'hybridation ou l'expression génique, p.ex. microréseaux, séquençage par hybridation, normalisation, profilage, modèles de correction de bruit, estimation du ratio d'expression, conception ou optimisation de sonde
G PHYSIQUE
06
CALCUL; COMPTAGE
F
TRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19
Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10
Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
22
pour la comparaison de séquences impliquant des nucléotides ou des acides aminés, p.ex. recherche d'homologie, identification de motifs ou de SNP [polymorphismes de nucléotides simples] ou alignement de séquences
G PHYSIQUE
01
MÉTROLOGIE; ESSAIS
N
RECHERCHE OU ANALYSE DES MATÉRIAUX PAR DÉTERMINATION DE LEURS PROPRIÉTÉS CHIMIQUES OU PHYSIQUES
1
Echantillonnage; Préparation des éprouvettes pour la recherche
28
Préparation d'échantillons pour l'analyse
Déposants :
10X GENOMICS, INC. [US/US]; 7068 Koll Center Parkway Suite 401 Pleasanton, CA 94566, US
FRED HUTCHINSON CANCER RESEARCH CENTER [US/US]; 1100 Fairview Avenue North Seattle, WA 98109, US
Inventeurs :
ZHENG, Xinying; US
BIELAS, Jason, H.; US
GREGORY, Mark, T.; US
HINDSON, Benjamin; US
MIKKELSEN, Tarjei, Sigurd; US
WILSON, Ryan; US
RYVKIN, Paul; US
Mandataire :
LAM, Amy; US
AGRAWAL, Trisha; US
ALEMOZAFAR, Ali; US
ALMEDA, Dariela; US
ADVANI, Raj; US
Données relatives à la priorité :
62/293,96611.02.2016US
62/365,96122.07.2016US
62/365,96222.07.2016US
Titre (EN) CELL POPULATION ANALYSIS USING SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS FROM SINGLE CELL TRANSCRIPTOMES
(FR) ANALYSE DE POPULATION CELLULAIRE UTILISANT DES POLYMORPHISMES DE NUCLÉOTIDE SIMPLE À PARTIR DE TRANSCRIPTOMES MONOCELLULAIRES
Abrégé :
(EN) The disclosure provides methods and systems for producing single cell RNA sequencing data. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) identified in such data can be used to distinguish subpopulations of cells within a mixed population.
(FR) L'invention concerne des méthodes et des systèmes pour produire des données de séquençage d'ARN monocellulaire. Des polymorphismes de nucléotide simple (SNP) identifiés dans ces données peuvent être utilisés pour distinguer des sous-populations de cellules dans une population mixte.
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États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)