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1. (WO2017035090) PCR DUMBBELL : UN PROCÉDÉ POUR QUANTIFIER DES VARIANTS SPÉCIFIQUES DE PETIT ARN PRÉSENTANT UNE RÉSOLUTION NUCLÉOTIDIQUE UNIQUE AU NIVEAU DES SÉQUENCES TERMINALES
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2017/035090    N° de la demande internationale :    PCT/US2016/048075
Date de publication : 02.03.2017 Date de dépôt international : 22.08.2016
CIB :
C12Q 1/68 (2006.01), C12N 15/09 (2006.01), C12N 15/10 (2006.01), C12N 15/113 (2010.01), A61K 31/7115 (2006.01)
Déposants : THOMAS JEFFERSON UNIVERSITY [US/US]; 901 Walnut Street Innovation Pillar Philadelphia, Pennsylvania 19107 (US)
Inventeurs : KIRINO, Yohei; (US).
HONDA, Shozo; (US)
Mandataire : VOS STRACHE, Kyle; (US)
Données relatives à la priorité :
62/208,183 21.08.2015 US
Titre (EN) DUMBBELL-PCR: A METHOD TO QUANTIFY SPECIFIC SMALL RNA VARIANTS WITH A SINGLE NUCLEOTIDE RESOLUTION AT TERMINAL SEQUENCES
(FR) PCR DUMBBELL : UN PROCÉDÉ POUR QUANTIFIER DES VARIANTS SPÉCIFIQUES DE PETIT ARN PRÉSENTANT UNE RÉSOLUTION NUCLÉOTIDIQUE UNIQUE AU NIVEAU DES SÉQUENCES TERMINALES
Abrégé : front page image
(EN)A method for specifically and efficiently quantify the expression of targeted RNA variants with specific terminal sequences suitable to identify multiple isoforms bearing complex heterogeneity in terminal sequences by hybridizing a 5'-Dbs-adapter to the 5'-end of target RNAs, wherein the 5'-Dbs-adapter has a stem-loop structure whose protruding 5'-end base-pairs 5'-end of target RNAs, and wherein the loop region of 5'-Dbs-adapter contains a base-lacking spacer which will terminate reverse transcription in a subsequent step; hybridizing a 3'-Db-adapter to the 3'-end of target RNAs, wherein the 3'-Db-adapter has a stem-loop structure whose protruding 3'-end base-pairs 3'-end of target RNAs; ligating the both adapters with target RNAs by Rnl2 ligation to form "dumbbell-like" structure; and, amplifying and quantifying the ligation product by TaqMan RT-PCR.
(FR)L'invention concerne un procédé pour quantifier spécifiquement et efficacement l'expression de variants ciblés d'ARN présentant des séquences terminales spécifiques, approprié pour identifier de multiples isoformes portant une hétérogénéité complexe dans les séquences terminales par hybridation d'un adaptateur 5'-Dbs à l'extrémité 5' des ARN cibles, l'adaptateur 5'-Dbs présentant une structure de type tige-boucle dont les paires de bases en saillie de l'extrémité 5' terminent l'extrémité 5' d'ARN cibles et la région de boucle de l'adaptateur 5'-Dbs contenant un espaceur dont une base est absente qui terminera la transcription inverse dans une étape ultérieure ; hybridation d'un adaptateur 3'-Db à l'extrémité 3' des ARN cibles, l'adaptateur 3'-Db présentant une structure de type tige-boucle dont les paires de bases en saillie de l'extrémité 3' terminent l'extrémité 3' d'ARN cibles ; ligature des deux adaptateurs aux ARN cibles par une ligature Rnl2 pour former une structure de type "dumbbell" (haltère) ; et amplification et quantification du produit de ligature par RT-PCR TaqMan.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)