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1. (WO2016209037) PROCÉDÉ D'EXPLORATION DE RESSOURCES GÉNÉTIQUES UTILES PAR ANALYSE MÉTAGÉNOMIQUE MASSIVE ET SON UTILISATION
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2016/209037    N° de la demande internationale :    PCT/KR2016/006792
Date de publication : 29.12.2016 Date de dépôt international : 24.06.2016
CIB :
C12Q 1/68 (2006.01)
Déposants : KYUNGPOOK NATIONAL UNIVERSITY INDUSTRY-ACADEMIC COOPERATION FOUNDATION [KR/KR]; (Sangyeok-dong), 80, Daehak-ro Buk-gu Daegu 41566 (KR)
Inventeurs : LEE, Dong Woo; (KR).
LEE, Yong Jik; (KR).
LEE, Sang Jae; (KR).
LEE, Han Seung; (KR)
Mandataire : KIM, Soon Woong; (KR)
Données relatives à la priorité :
10-2015-0089772 24.06.2015 KR
10-2016-0079254 24.06.2016 KR
Titre (EN) METHOD FOR EXPLORING USEFUL GENETIC RESOURCES THROUGH BULK METAGENOME ANALYSIS AND USE THEREOF
(FR) PROCÉDÉ D'EXPLORATION DE RESSOURCES GÉNÉTIQUES UTILES PAR ANALYSE MÉTAGÉNOMIQUE MASSIVE ET SON UTILISATION
(KO) 대용량 메타지놈 분석을 통한 유용 유전자원 탐색 방법 및 이의 이용
Abrégé : front page image
(EN)The present invention relates to a degenerate primer for analyzing bulk metagenome information, and a method and a kit for analyzing metagenome information using the same. The method for analyzing metagenome information, according to the present invention, and a primer set used therefor can be applied to the present invention in order to rapidly determine the utility value of extensive metagenome samples. In particular, a superfamily-specific degenerate primer of the present invention can be used to rapidly determine the presence or absence of genetic information of target peptides in a metagenome by a simple method, and therefore can be used to collect large amounts of useful peptide resource information at a high speed from various metagenome samples. In addition, based on the method of the present invention, it can be used to explore a new peptide gene through design and manufacturing of a superfamily-specific degenerate primer of new target peptides. In addition, the method of the present invention can be applied to research relating to polypeptides, oligopeptides, antibiotic resistant genes, antimicrobial peptides, anti-fungal peptides, oligopeptides, markers, or Single-Nucleotide Polymorphism (SNP), as well as enzymes.
(FR)La présente invention concerne une amorce dégénérée pour analyser des informations métagénomiques massives et un procédé et un kit pour analyser des informations métagénomiques l'utilisant. Le procédé d'analyse d'informations métagénomiques, selon la présente invention, et un ensemble d'amorces utilisé à cet effet peuvent être appliqués à la présente invention afin de déterminer rapidement la valeur d'utilité d'échantillons métagénomiques importants. En particulier, une amorce dégénérée spécifique à une superfamille de la présente invention peut être utilisée pour déterminer rapidement la présence ou l'absence d'informations génétiques de peptides cibles dans un métagénome par un procédé simple et, par conséquent, peut être utilisée pour collecter de grandes quantités d'informations de ressources peptidiques utiles à une vitesse élevée à partir de divers échantillons métagénomiques. En outre, sur base du procédé de la présente invention, elle peut être utilisée pour explorer un nouveau gène de peptide via la conception et la production d'une amorce dégénérée spécifique à une superfamille de nouveaux peptides cibles. De plus, le procédé de la présente invention peut être appliqué à la recherche se rapportant à des polypeptides, des oligopeptides, des gènes résistant aux antibiotiques, des peptides antimicrobiens, des peptides antifongiques, des oligopeptides, des marqueurs ou le polymorphisme d'un seul nucléotide (SNP), ainsi que des enzymes.
(KO)본 발명은 대용량 메타지놈 정보 분석을 위한 디제너레이트 프라이머 및 이를 이용하여 메타지놈 정보를 분석하는 방법 및 키트에 관한 것이다. 본 발명에 따른 메타지놈의 정보 분석 방법, 및 이에 이용되는 프라이머 세트는 방대한 메타지놈 샘플 효용 가치의 빠른 판별을 위하여 본 발명이 적용될 수 있다. 특히, 본 발명의 슈퍼패밀리-특이적 (superfamily-specific) 디제너레이트 프라이머를 이용하여 메타지놈에서 목적 펩타이드들의 유전정보의 유무를 간단한 방법에 의해 빠르게 탐색할 수 있으므로 다양한 메타지놈 샘플로부터 고속으로 대량의 유용 펩타이드 자원 정보를 수집하는데 사용이 가능하다. 또한, 이러한 본 발명의 방법을 기반으로 하여 목적하는 새로운 펩타이드들의 슈퍼패밀리-특이적 디제너레이트 프라이머 설계 및 제작을 통하여 새로운 펩타이드 유전자를 탐색하는데 사용이 가능하다. 또한, 이러한 방법은 효소뿐 만 아니라, 폴리펩타이드, 올리고펩타이드, 항생제 내성 유전자, 항균펩타이드, 항진균펩타이드, 올리고펩타이드, 마커 또는 SNP (Single-Nucleotide Polymorphism) 관련 연구에도 본 발명의 방법이 적용될 수 있다.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : coréen (KO)
Langue de dépôt : coréen (KO)