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1. (WO2016191272) PROCÉDÉS DE SÉQUENÇAGE DU GÉNOME DE NOUVELLE GÉNÉRATION ET COMPOSITIONS ET KITS ASSOCIÉS
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2016/191272    N° de la demande internationale :    PCT/US2016/033506
Date de publication : 01.12.2016 Date de dépôt international : 20.05.2016
CIB :
C12Q 1/68 (2006.01), C12P 19/34 (2006.01), C07H 21/04 (2006.01), C40B 20/04 (2006.01)
Déposants : SIGMA-ALDRICH CO. LLC [US/US]; 3050 Spruce Street St. Louis, Missouri 63103 (US)
Inventeurs : WARD, Brian; (US)
Mandataire : BISSEN, Shirley T.; (US)
Données relatives à la priorité :
62/165,627 22.05.2015 US
Titre (EN) METHODS FOR NEXT GENERATION GENOME WALKING AND RELATED COMPOSITIONS AND KITS
(FR) PROCÉDÉS DE SÉQUENÇAGE DU GÉNOME DE NOUVELLE GÉNÉRATION ET COMPOSITIONS ET KITS ASSOCIÉS
Abrégé : front page image
(EN)Methods are provided herein for identifying rare and/or unknown DNA sequences by next-generation sequencing approaches. Isolated double-stranded (ds), single-stranded (ss), or ds/ss DNA is fragmented and the fragments are polished, phosphorylated, and tailed, as necessary. Fragmentation can be enzymatic or mechanical. A universal adapter sequence is ligated to each fragment, wherein the adapter can have a top strand without a 5' phosphate, a 3' with an -H in place of the -OH, and/or a 3' extra base complementary to any base added to the polished fragments. The ligatamers may then serve as templates for ampli?cation using a forward primer complementary to the adapter sequence and a reverse primer targeted to the fragment sequence. Compositions produced by these methods and kits adapted for performing these methods are also described herein.
(FR)La présente invention concerne des procédés permettant d'identifier des séquences d'ADN rares et/ou inconnues par des approches de séquençage de nouvelle génération. De l'ADN isolé à double brin (ds), à simple brin (ss), ou à ds/ss est fragmenté et les fragments sont polis, phosphorylés, et une queue leur est éventuellement rajoutée. La fragmentation peut être enzymatique ou mécanique. Une séquence d'adaptateur universel est ligaturée à chaque fragment, ledit adaptateur pouvant comprendre un brin supérieur ne comprenant pas de phosphate à l'extrémité 5', ayant une extrémité 3' comprenant un -H à la place du -OH, et/ou une base supplémentaire à l'extrémité 3' complémentaire d'une quelconque base ajoutée aux fragments polis. Les ligatamères peuvent ensuite servir de modèles pour l'amplification à l'aide d'une amorce sens complémentaire de la séquence d'adaptateur et d'une amorce antisens ciblée sur la séquence de fragments. L'invention concerne également des compositions produites par ces procédés et des kits conçus pour mettre en œuvre ces procédés.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)