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1. (WO2016011563) SYSTÈME ET PROCÉDÉ DE COMMANDE D'UN PROCESSUS DE SÉQUENÇAGE DE GÈNE
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication : WO/2016/011563 N° de la demande internationale : PCT/CA2015/050710
Date de publication : 28.01.2016 Date de dépôt international : 27.07.2015
CIB :
G06F 19/10 (2011.01) ,C12M 1/34 (2006.01) ,C12Q 1/68 (2006.01) ,G06F 19/22 (2011.01)
G PHYSIQUE
06
CALCUL; COMPTAGE
F
TRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19
Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10
Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
12
BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
M
APPAREILLAGE POUR L'ENZYMOLOGIE OU LA MICROBIOLOGIE
1
Appareillage pour l'enzymologie ou la microbiologie
34
Mesure ou essai par des moyens de mesure ou de détection des conditions du milieu, p.ex. par des compteurs de colonies
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
12
BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
Q
PROCÉDÉS DE MESURE, DE RECHERCHE OU D'ANALYSE FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1
Procédés de mesure, de recherche ou d'analyse faisant intervenir des enzymes ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68
faisant intervenir des acides nucléiques
G PHYSIQUE
06
CALCUL; COMPTAGE
F
TRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19
Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10
Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
22
pour la comparaison de séquences impliquant des nucléotides ou des acides aminés, p.ex. recherche d'homologie, identification de motifs ou de SNP [polymorphismes de nucléotides simples] ou alignement de séquences
Déposants : ONTARIO INSTITUTE FOR CANCER RESEARCH[CA/CA]; Mars Centre, South Tower, Suite 500 101 College Street Toronto, Ontario M5G 1L7, CA
Inventeurs : BOUTROS, Paul C.; CA
CHONG, Lauren; CA
LALANSINGH, Christopher; CA
ALBUQUERQUE, Marco; CA
Mandataire : CHIU, Jung-Kay; CA
Données relatives à la priorité :
62/029,11225.07.2014US
Titre (EN) SYSTEM AND METHOD FOR PROCESS CONTROL OF GENE SEQUENCING
(FR) SYSTÈME ET PROCÉDÉ DE COMMANDE D'UN PROCESSUS DE SÉQUENÇAGE DE GÈNE
Abrégé :
(EN) Systems, methods and computer-readable media are provided for determining the amount of sequencing required to achieve a target sequencing quality of a genetic sample to be sequenced. The method comprises receiving a genetic sample and sequencing a portion of the genetic sample. A sequencing quality metric belonging to a category of sequencing quality metrics is generated from the sequencing. The amount of sequencing of the genetic sample required to achieve the target sequencing quality is determined by inputting the sequencing quality metric into a trained model. A system is also disclosed for genetic sequencing. Corresponding methods and computer-readable media are also provided.
(FR) La présente invention concerne des systèmes, des procédés et des supports lisibles par ordinateur permettant de déterminer la quantité de séquençage nécessaire pour obtenir une qualité de séquençage cible d'un échantillon génétique devant être séquencé. Le procédé comprend les étapes consistant à : recevoir un échantillon génétique et à en séquencer une partie; à partir du séquençage, établir une métrique de qualité de séquençage relevant d'une catégorie de métriques de qualité de séquençage; et déterminer la quantité de séquençage de l'échantillon génétique nécessaire pour obtenir la qualité de séquençage cible en entrant la métrique de qualité de séquençage dans un modèle entraîner. La présente invention concerne également un système de séquençage génétique, ainsi que des procédés et des supports lisibles par ordinateur correspondants.
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États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)