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1. (WO2016004368) ÉTIQUETAGE ET ÉVALUATION D'UNE SÉQUENCE CIBLE
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2016/004368    N° de la demande internationale :    PCT/US2015/039080
Date de publication : 07.01.2016 Date de dépôt international : 02.07.2015
CIB :
C12N 15/10 (2006.01), C12N 15/66 (2006.01)
Déposants : RHODX, INC. [US/US]; 13823 Recuerdo Drive Del Mar, CA 92014-3126 (US)
Inventeurs : RODI, Charles; (US)
Mandataire : EINHORN, Gregory P.; (US)
Données relatives à la priorité :
62/151,320 22.04.2015 US
62/020,823 03.07.2014 US
Titre (EN) TAGGING AND ASSESSING A TARGET SEQUENCE
(FR) ÉTIQUETAGE ET ÉVALUATION D'UNE SÉQUENCE CIBLE
Abrégé : front page image
(EN)Provided in certain aspects are methods for dynamically adding molecular indexes to nucleic acid, and optionally analyzing the tagged nucleic acid. Also provided in certain aspects are methods for producing a single-stranded nucleic acid molecule from two molecules. The first molecule typically is a single-stranded nucleic acid (ssNA) containing a target sequence with optional linked nucleic acid sequences. The second molecule typically is a ssNA containing a target binding sequence and a nucleic acid sequence "tag" that is not complementary to the target sequence. The first and second ssNA molecules can be hybridized or annealed under conditions in which the target sequence and target binding sequence hybridize or anneal to each other by base pair complementarity, followed by contact of the hybridized or annealed molecules with a single-stranded nucleic acid ligase activity that ligates the 3'-end of the first ssNA molecule with the 5'phosphate (optionally adenylated) moiety of the second ssNA molecule to produce one product, a ligated ssNA molecule.
(FR)Selon certains aspects, cette invention concerne des procédés d'ajout dynamique d'index moléculaires à un acide nucléique, et éventuellement d'analyse de l'acide nucléique étiqueté. Selon d'autres aspects, cette invention concerne également des procédés de production d'une molécule d'acide nucléique simple brin à partir de deux molécules. La première molécule est généralement un acide nucléique simple brin (ssNA) contenant une séquence cible et des séquences d'acides nucléiques liées facultatives. La seconde molécule est généralement un ssNA contenant une séquence se liant à la cible et une séquence d'acide nucléique "étiquette" qui n'est pas complémentaire de la séquence cible. Les première et seconde molécules ssNA peuvent s'hybrider et s'anneler dans des conditions dans lesquelles la séquence cible et la séquence se liant à la cible s'hybrident ou s'annèlent l'une à l'autre par complémentarité de paires de bases, puis les molécules hybridées ou annelées sont mises en contact avec un acide nucléique simple brin ayant une activité ligase qui ligature l'extrémité 3' de la première molécule ssNA au fragment 5'-phosphate (éventuellement adénylé) de la seconde molécule ssNA pour obtenir un produit, une molécule ssNA ligaturée.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)