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1. (WO2015134664) PROCÉDÉS ET SYSTÈMES D'ALIGNEMENT DE SÉQUENCES BIOLOGIQUES
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2015/134664    N° de la demande internationale :    PCT/US2015/018819
Date de publication : 11.09.2015 Date de dépôt international : 04.03.2015
CIB :
G01N 33/50 (2006.01), C40B 30/02 (2006.01), C40B 50/02 (2006.01)
Déposants : ARC BIO, LLC [US/US]; 16 Cherry Street Cambridge, MA 02139 (US)
Inventeurs : GODINEZ-MORENO, Ricardo; (US).
QUIROZ-ZARATE, Alejandro; (US).
COSTE, Pablo, G.; (US).
OLIVARES-AMAYA, Roberto; (US).
WATSON, Thomas, J., Jer.; (US)
Mandataire : COOK, Jack, M.; (US)
Données relatives à la priorité :
61/947,874 04.03.2014 US
Titre (EN) METHODS AND SYSTEMS FOR BIOLOGICAL SEQUENCE ALIGNMENT
(FR) PROCÉDÉS ET SYSTÈMES D'ALIGNEMENT DE SÉQUENCES BIOLOGIQUES
Abrégé : front page image
(EN)A method for transforming a plurality of random biological sequence data to an ordered biological data sequence, the method comprises reading a reference biological data sequence; generating a plurality of indexes based on the reference biological data sequence; generating a library, the library including the plurality of indexes; organizing the library into an associative array; reading the plurality of random biological sequence data; encoding the plurality of random biological sequence data; comparing the encoded plurality of random biological sequence data to the reference biological sequence; and aligning the encoded plurality of random biological sequence data to the reference biological sequence using an alignment algorithm to generate a plurality of alignment data.
(FR)L'invention concerne un procédé permettant de transformer une pluralité de données de séquences biologiques aléatoires en des données de séquences biologiques ordonnées, le procédé comprenant la lecture d'une séquence de données biologiques de référence ; la génération d'une pluralité d'indices en se basant sur la séquence de données biologiques de référence ; la génération d'une banque, la banque comprenant la pluralité d'indices ; l'organisation de la banque en une matrice associative ; la lecture de la pluralité de données de séquences biologiques aléatoires ; le codage de la pluralité de données de séquences biologiques aléatoires ; la comparaison de la pluralité codée de données de séquences biologiques aléatoires à la séquence biologique de référence ; et l'alignement de la pluralité codée de données de séquences biologiques aléatoires à la séquence biologique de référence à l'aide d'un algorithme d'alignement pour générer une pluralité de données d'alignement.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)