WIPO logo
Mobile | Deutsch | English | Español | 日本語 | 한국어 | Português | Русский | 中文 | العربية |
PATENTSCOPE

Recherche dans les collections de brevets nationales et internationales
World Intellectual Property Organization
Recherche
 
Options de navigation
 
Traduction
 
Options
 
Quoi de neuf
 
Connexion
 
Aide
 
Traduction automatique
1. (WO2015104411) PROCÉDÉ DE DÉCONVOLUTION DE MÉLANGES DE SUBSTANCES CONTENANT UN ACIDE NUCLÉIQUE
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2015/104411    N° de la demande internationale :    PCT/EP2015/050414
Date de publication : 16.07.2015 Date de dépôt international : 12.01.2015
CIB :
C12Q 1/68 (2006.01)
Déposants : TECHNISCHE UNIVERSITÄT DRESDEN [DE/DE]; Mommsenstraße 13 01069 Dresden (DE)
Inventeurs : ZHANG, Yixin; (DE).
HERRMANN, Jana; (DE).
WIEDUWILD, Robert; (DE).
BODEN, Annett; (DE)
Mandataire : RIEPE, Hans-Gerd; (DE)
Données relatives à la priorité :
10 2014 200 446.2 13.01.2014 DE
Titre (DE) VERFAHREN ZUR DEKONVOLUTION NUKLEINSÄURE ENTHALTENDER SUBSTANZGEMISCHE
(EN) METHOD FOR DECONVOLUTION OF NUCLEIC ACID-CONTAINING SUBSTANCE MIXTURES
(FR) PROCÉDÉ DE DÉCONVOLUTION DE MÉLANGES DE SUBSTANCES CONTENANT UN ACIDE NUCLÉIQUE
Abrégé : front page image
(DE)Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur Dekonvolution Nukleinsäure enthaltender Substanzgemische unter Verwendung synthetisch generierter Target-Nukleotidsequenzen. Gemäß der vorliegenden Erfindung wird dabei so vorgegangen, dass aus mehreren Nukleotiden (A, C, G, T/U) nach einem vorgegebenen Algorithmus mehrere sich voneinander unterscheidende Target-Nukleotidsequenzen (TNS) (A1 - An, B1 - Bn,..., Zn) mit N0 - Nn Sequenzpositionen generiert werden. In einem weiteren Schritt wird jeweils mindestens eine der generierten TNS (A1 - An, B1 - Bn,..., Zn) mindestens einer Substanz oder einer Substanzkombination zugeordnet und mit dieser chemisch gekoppelt. Ferner wird bei dem erfindungsgemäßen Verfahren mindestens ein zu analysierendes Substanzgemisch mit mindestens zwei unterschiedlichen darin enthaltenen TNS und/oder TNS-gekoppelten Substanzen bereitgestellt, das nach einem Sequenzierungsverfahren sequenziert wird, wobei gleichzeitig sämtliche in dem Substanzgemisch enthaltene TNS (A1 - An, B1 - Bn,..., Zn) oder weitere Nukleinsäuren bzw. Nukleotidsequenzen in einem gemeinsamen Sequenzspektrum erfasst werden. Zur Erleichterung der Dekonvolution und somit zur Identifikation angereicherter TNS sollten die Sequenzspektren eines Substanzgemisches vor und nach einem Selektionsexperiment voneinander abgezogen/subtrahiert werden.
(EN)The invention relates to a method for the deconvolution of nucleic acid-containing substance mixtures using synthetically generated target nucleotide sequences. According to the invention, starting from a plurality of nucleotides (A, C, G, T/U), a plurality of different target nucleotide sequences (TNS) (A1 - An, B1 - Bn,..., Zn) having N0 - Nn sequence positions is generated according to a predetermined algorithm. In a further step at least one of the TNS (A1 - An, B1 - Bn,..., Zn) generated is associated with at least one substance or one substance combination and is chemically coupled thereto. At least one substance mixture to be analyzed and having at least two different TNS and/or TNS-coupled substances contained therein is provided and is sequenced according to a sequencing method, at the same time all TNS (A1 - An, B1 - Bn,..., Zn) contained in the substance mixture or further nucleic acids or nucleic acid sequences are detected in a common sequence spectrum. In order to facilitate the deconvolution and thus the identification of enriched TNS, the sequence spectra of a substance mixture should be deducted/subtracted from each other prior to and after a selection experiment.
(FR)L'invention concerne un procédé de déconvolution de mélanges de substances contenant un acide nucléique par utilisation de séquences nucléotidiques cibles générées par synthèse. Selon la procédure de la présente invention, plusieurs séquences de nucléotides cibles (TNS) différentes les unes des autres, (A1 à An, B1 à Bn, …, Zn) comportant N0 à Nn positions de séquence sont générées à partir d'une pluralité de nucléotides (A, C, G, T/U) selon un algorithme prédéterminé. Dans une autre étape, au moins une des TNS générées (A1 à An, B1 à Bn, …, Zn) est associée et couplée chimiquement à au moins une substance ou une combinaison de substances. En outre, dans le procédé de l'invention, on produit au moins un mélange de substances à analyser qui comporte au moins deux TNS et/ou substances couplées à des TNS différentes contenues à l'intérieur et qui est séquencé par un procédé de séquençage, toutes les TNS (A1 à An, B1 à Bn, …, Zn) ou d'autres acides nucléiques ou séquences de nucléotides, contenus dans le mélange de substances, étant détectés simultanément dans un spectre de séquence commun. Pour faciliter la déconvolution et donc identifier des TNS enrichis, les spectres de séquence d'un mélange de substances sont retirés ou soustraits les uns des autres avant et après une expérience de sélection.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : allemand (DE)
Langue de dépôt : allemand (DE)