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1. (WO2014089356) SYSTÈME ET PROCÉDÉ DE PRÉDICTION INFORMATIQUE DE L'EXPRESSION DE PHÉNOTYPES MONOGÉNIQUES
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2014/089356    N° de la demande internationale :    PCT/US2013/073415
Date de publication : 12.06.2014 Date de dépôt international : 05.12.2013
CIB :
C40B 50/04 (2006.01), G01N 33/50 (2006.01), G06F 19/00 (2011.01), G06G 7/58 (2006.01)
Déposants : GENEPEEKS, INC. [US/US]; 175 Varick Street New York, New York 10013 (US)
Inventeurs : SILVER, Lee M.; (US).
COHN, Adam; (US).
SILVER, Ari Julian; (US)
Mandataire : PEARL COHEN ZEDEK LATZER BARATZ LLP; 1500 Broadway, 12th Floor New York, New York 10036 (US)
Données relatives à la priorité :
61/733,600 05.12.2012 US
Titre (EN) SYSTEM AND METHOD FOR THE COMPUTATIONAL PREDICTION OF EXPRESSION OF SINGLE-GENE PHENOTYPES
(FR) SYSTÈME ET PROCÉDÉ DE PRÉDICTION INFORMATIQUE DE L'EXPRESSION DE PHÉNOTYPES MONOGÉNIQUES
Abrégé : front page image
(EN)In accordance with an embodiment of the invention, a system and method is provided for determining a probability of a progeny having one or more phenotypes Phj each associated with a single gene Qj. A score sip may be assigned to each allele hip at a plurality of genetic loci (i) in a haploid genome profile Hp of a parent (p). A plurality (Nj) of the alleles hkp (k=1,...,Nj) associated with the gene Qj may be identified. The scores sip may be mapped or indexed to gene- specific scores ŝj,kp associated with gene Qj for the plurality of (Nj) alleles hkp. A probability may be computed for altering the gene product from gene Qj in a progeny of the parent (p) to be a function of the gene- specific scores ŝj,kp.
(FR)Selon un mode de réalisation, l'invention concerne un système et un procédé pour déterminer une probabilité selon laquelle une descendance possède un ou plusieurs phénotypes Phj dont chacun est associé à un seul gène Qj. Il est possible d'attribuer un score sip à chaque allèle hip à une pluralité de loci génétiques (i) dans un profil génomique haploïde Hp d'un parent (p). Il est aussi possible d'identifier une pluralité (Nj) des allèles hkp (k=1,...,Nj) associés au gène Qj. Il est possible de mapper les scores sip ou de les indexer par rapport aux scores spécifiques de gènes ŝj,kp associés au gène Qj pour la pluralité (Nj) d'allèles hkp. Il est possible de calculer une probabilité de modification du produit génique du gène Qj chez une descendance du parent (p) en fonction des scores spécifiques de gènes ŝj,kp.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)