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1. (WO2014009413) AMPLIFICATION DÉPENDANTE DE LA PROTECTION EN 5'
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2014/009413    N° de la demande internationale :    PCT/EP2013/064582
Date de publication : 16.01.2014 Date de dépôt international : 10.07.2013
CIB :
C12N 15/10 (2006.01), C12P 19/34 (2006.01), C12Q 1/68 (2006.01)
Déposants : LEXOGEN GMBH [AT/AT]; Campus-Vienna-Biocenter 5 Helmut Qualtinger-Gasse 6 1030 Vienna (AT)
Inventeurs : SEITZ, Alexander; (AT).
GABLER, Irmlind; (AT).
PAUL, Lukas; (AT)
Mandataire : SONN & PARTNER PATENTANWÄLTE; Riemergasse 14 1010 Vienna (AT)
Données relatives à la priorité :
12175694.4 10.07.2012 EP
Titre (EN) 5´ PROTECTION DEPENDENT AMPLIFICATION
(FR) AMPLIFICATION DÉPENDANTE DE LA PROTECTION EN 5'
Abrégé : front page image
(EN)The present invention relates to methods for generating a labelled nucleic acid from an RNA comprising a 5' protecting group, said method comprises the steps of obtaining a mixture of template strands of nucleic acids, said mixture comprising said RNA and further potentially other nucleic acids without a 5' protecting group, annealing at least one oligonucleotide primer to the template strand of said RNA and potentially other nucleic acids, and template sequence dependent extending said primer, thereby obtaining a complementary nucleic acid strand annealed to its template strand, or providing the RNA in duplex with a complementary nucleic acid strand annealed to its template strand, and optionally modifying the extension product of said nucleic acids without 5' protecting group either on the 5' end of the template strand or on the 3' end of the complementary strand, or both, and labelling a complementary nucleic acid of a double stranded nucleic acid not modified, wherein therefore the labelled nucleic acid did have a 5' protecting group on the RNA template strand, said 5' protecting group being optionally removed after modification, and/or labelling a complementary nucleic acid of a double strand dependent on the presence of the 5' protecting group on the complementary nucleic acids template RNA strand by double strand dependent ligation, thereby specifically generating a labelled nucleic acid complementary to an RNA at least originally comprising a 5' protecting group.
(FR)La présente invention concerne des procédés pour générer un acide nucléique marqué à partir d'un ARN comprenant un groupe protecteur en 5', ledit procédé comprenant les étapes d'obtention d'un mélange de brins matrices d'acides nucléiques, ledit mélange comprenant ledit ARN et potentiellement d'autres acides nucléiques supplémentaires sans groupe protecteur en 5', d'hybridation d'au moins une amorce oligonucléotidique au brin matrice dudit ARN et potentiellement d'autres acides nucléiques, et d'extension de ladite amorce de façon dépendante de la séquence matrice, obtenant ainsi un brin d'acide nucléique complémentaire hybridé à son brin matrice, ou d'apport de l'ARN en duplex avec un brin d'acide nucléique complémentaire hybridé à son brin matrice, et facultativement de modification du produit d'extension desdits acides nucléiques sans groupe protecteur en 5' soit à l'extrémité 5' du brin matrice soit à l'extrémité 3' du brin complémentaire, ou aux deux, et de marquage d'un acide nucléique complémentaire d'un acide nucléique à double brin non modifié, où, par conséquent, l'acide nucléique marqué avait un groupe protecteur en 5' sur le brin matrice d'ARN, ledit groupe protecteur en 5' étant facultativement éliminé après modification et/ou de marquage d'un acide nucléique complémentaire d'un double brin dépendant selon la présence du groupe protecteur en 5' sur le brin d'ARN de matrice d'acides nucléiques complémentaires par la ligature dépendante de double brin, générant ainsi spécifiquement un acide nucléique marqué complémentaire d'un ARN comprenant au moins un groupe protecteur en 5' à l'origine.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)