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1. (WO2013070115) PROCÉDÉ D'IDENTIFICATION DE GENRE ET DE SOUCHE DES BIFIDOBACTÉRIES UTILISANT LES GÈNES DES SYSTÈMES TOXINE-ANTITOXINE DE TYPE II DES SUPERFAMILLES MAZEF ET RELBE
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2013/070115    N° de la demande internationale :    PCT/RU2012/000836
Date de publication : 16.05.2013 Date de dépôt international : 16.10.2012
CIB :
C12Q 1/68 (2006.01)
Déposants : AVTONOMNAJA NEKOMMERCHESKAJA ORGANIZACIJA "NAUCHNO-ISSLEDOVATEL'SKIJJ CENTR BIOTEKHNOLOGII ANTIBIOTIKOV I DRUGIKH BIOLOGICHESKI AKTIVNYKH VESHHESTV "BIOAN" [RU/RU]; GSP-1, ul. Gubkina, 3 Moscow, 119991 (RU) (Tous Sauf US).
ALEKSEEVA, Marija Georgievna [RU/RU]; (RU) (US only).
AVERINA, Ol'ga Viktorovna [RU/RU]; (RU) (US only).
DANILENKO, Valeriy Nikolaevich [RU/RU]; (RU) (US only)
Inventeurs : ALEKSEEVA, Marija Georgievna; (RU).
AVERINA, Ol'ga Viktorovna; (RU).
DANILENKO, Valeriy Nikolaevich; (RU)
Mandataire : MOKHOV, Yevgeniy Valyer'yevich; Visokovol'tniy proyezd, 1/3-192 Moscow, 127566 (RU)
Données relatives à la priorité :
2011145069 08.11.2011 RU
Titre (EN) METHOD FOR IDENTIFYING SPECIES AND STRAINS OF BIFIDOBACTERIA USING GENES OF THE TYPE II TOXIN-ANTITOXIN SYSTEMS OF THE MAZEF AND REIBE SUPERFAMILIES
(FR) PROCÉDÉ D'IDENTIFICATION DE GENRE ET DE SOUCHE DES BIFIDOBACTÉRIES UTILISANT LES GÈNES DES SYSTÈMES TOXINE-ANTITOXINE DE TYPE II DES SUPERFAMILLES MAZEF ET RELBE
(RU) МЕТОД ВИДОВОЙ И ШТАММОВОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ БИФИДОБАКТЕРИЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ГЕНОВ СИСТЕМ ТОКСИН-АНТИТОКСИН II ТИПА СУПЕРСЕМЕЙСТВ MAZEF И REIBE
Abrégé : front page image
(EN)The invention relates to biotechnology, in particular to the production of bacterial preparations and foodstuffs, as well as to medical microbiology and may be used to identify strains of bifidobacteria. A method for identifying species and strains of bifidobacteria, based on the combination and polymorphism of genes of the toxin-antitoxin systems of the MazEF and ReIBE families, is proposed in the claimed invention. The technical result of the invention is as follows: performing amplification using the oligonucleotides developed, with the possible subsequent sequencing of DNA, enables the genotyping of bifidobacteria to be carried out accurately and quickly, including the typing of strains that are related to the В.longum phylotype. The oligonucleotides selected for such genes may be used for characterizing a strain and for ascertaining strain diversity in the ecological niche under examination. PCR with the use of these oligonucleotides may be envisaged as a diagnostic procedural approach for determining a strain under examination in clinical trials, or for the molecular tracking of a strain in commercial preparations for various existing diagnostic technologies and devices.
(FR)L'invention concerne la biotechnologie et notamment la fabrication de préparations bactériennes et d'aliments ainsi que la microbiologie médicale et peut s'utiliser pour l'identification des souches de bifidobactéries. Dans cette invention, on propose un procédé d'identification de genre et de souche des bifidobactéries basé sur la combinaison et le polymorphisme des gènes des systèmes toxine-antitoxine de type II des familles MazEF et RelBE. Le résultat technique de l'invention est le suivant : la réalisation de l'amplification utilisant les oligonucléotides développés, suivie d'un éventuel séquençage d'ADN, permet d'effectuer rapidement et avec exactitude le génotypage des bifidobactéries, y compris le typage des souches faisant partie du philotype B. longum. Les oligonucléotides sélectionnés pour ces gènes peuvent s'utiliser pour caractériser la souche pour mettre en évidences la diversité des souches dans une niche écologique examinée. La PCR utilisant ces oligonucléotides peut être présentée comme une approche diagnostique et méthodique pour déterminer la souche examinée dans les échantillons cliniques ou le suivi moléculaire de la souche dans des préparations de qualité commerciale, pour une pluralité de techniques et d'instruments diagnostiques existants.
(RU)Изобретение относится к биотехнологии, в частности к производству бактериальных препаратов и продуктов питания, а также к медицинской микробиологии и может быть использовано для идентификации штаммов бифидобактерий. В заявленном изобретении предложен метод видовой и штаммовой идентификации бифидобактерий, основанный на комбинации и полиморфизме генов систем токсин-антитоксин семейств MazEF и RelBE. Техническим результатом изобретения является: проведение амплификации с использованием разработанных олигонуклеотидов с возможным последующим секвенированием ДНК позволяет точно и быстро проводить генотипирование бифидобактерий, включая типирование штаммов, относящихся к филотипу В.longum. Олигонуклеотиды, подобранные к таким генам можно использовать для характеристики штамма, для выявления штаммового разнообразия в исследуемой экологической нише. ПЦР с использованием этих олигонуклеотидов можно представить как диагностический, методический подход для определения исследуемого штамма в клинических пробах или молекулярного отслеживания штамма в коммерческих препаратах для различных существующих диагностических технологий и приборов.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : russe (RU)
Langue de dépôt : russe (RU)