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1. WO2012008831 - GÉNÉRATION SIMPLIFIÉE DE CARTES PHYSIQUES DE NOVO À PARTIR DE BANQUES DE CLONES

Numéro de publication WO/2012/008831
Date de publication 19.01.2012
N° de la demande internationale PCT/NL2011/050505
Date du dépôt international 13.07.2011
CIB
C12Q 1/68 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
C12N 15/10 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
15Techniques de mutation ou génie génétique; ADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p.ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purification; Utilisation d'hôtes pour ceux-ci
09Technologie d'ADN recombinant
10Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
CPC
C12Q 1/6869
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6869Methods for sequencing
Déposants
  • KEYGENE N.V. [NL/NL]; P.O. Box 216 NL-6700 AE Wageningen, NL (AllExceptUS)
  • MICHIELS, An [BE/NL]; NL (UsOnly)
  • VAN OEVEREN, Adriaan Jan [NL/NL]; NL (UsOnly)
  • VAN EIJK, Michael Josephus Theresia [NL/NL]; NL (UsOnly)
Inventeurs
  • MICHIELS, An; NL
  • VAN OEVEREN, Adriaan Jan; NL
  • VAN EIJK, Michael Josephus Theresia; NL
Mandataires
  • DE LANG, R.J.; Exter Polak & Charlouis B.V. P.O. Box 3241 NL-2280 GE Rijswijk, NL
Données relatives à la priorité
61/363,77513.07.2010US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) SIMPLIFIED DE NOVO PHYSICAL MAP GENERATION FROM CLONE LIBRARIES
(FR) GÉNÉRATION SIMPLIFIÉE DE CARTES PHYSIQUES DE NOVO À PARTIR DE BANQUES DE CLONES
Abrégé
(EN)
The current invention relates to a method for the ordering of sequence tags from at least part of genome. The method at least comprises the steps of providing a genomic clone library, generating clone aliquots from the library, generating sequences tags from the clone aliquots, and ordering the sequence tags based on the combined presence of sequence tags in the clone aliquots. In one aspect, there is provided a method for the detection of genomic variation between at least two samples comprising the comparison of the ordered sequence tags of the samples and identifying any variation between the samples
(FR)
Cette invention concerne un procédé permettant d'ordonner des étiquettes de séquences provenant au moins en partie du génome. Le procédé comprend au moins les étapes consistant à utiliser une banque de clones génomiques, à générer des aliquotes de clones à partir de ladite banque, à générer des étiquettes de séquences à partir des aliquotes de clones, et à ordonner les étiquettes de séquences en fonction de la présence combinée d'étiquettes de séquences dans les aliquotes de clones. Selon un aspect, l'invention concerne un procédé de détection d'une variation génomique entre au moins deux échantillons, ledit procédé consistant à comparer les étiquettes de séquences ordonnées des échantillons et à identifier toute variation entre les échantillons.
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