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1. WO2012001576 - ANALYSE DE VOIES POUR FOURNIR DES INFORMATIONS PRÉDICTIVES

Numéro de publication WO/2012/001576
Date de publication 05.01.2012
N° de la demande internationale PCT/IB2011/052705
Date du dépôt international 21.06.2011
CIB
G06F 19/12 2011.01
GPHYSIQUE
06CALCUL; COMPTAGE
FTRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
12pour la modélisation ou la simulation en biologie des systèmes, p.ex. modèles probabilistes ou dynamiques, réseaux régulateurs de gènes, réseaux d'interaction protéique ou réseaux métaboliques
CPC
C12Q 1/6809
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6809Methods for determination or identification of nucleic acids involving differential detection
G16B 20/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
20ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
G16B 25/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
25ICT specially adapted for hybridisation; ICT specially adapted for gene or protein expression
G16B 40/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
40ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
G16B 5/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
5ICT specially adapted for modelling or simulations in systems biology, e.g. gene-regulatory networks, protein interaction networks or metabolic networks
Déposants
  • KONINKLIJKE PHILIPS ELECTRONICS N.V. [NL/NL]; Groenewoudseweg 1 NL-5621 BA Eindhoven, NL (AllExceptUS)
  • COLD SPRING HARBOR LABORATORY [US/US]; 1 Bungtown Road Cold Spring Harbor, New York 11724, US (AllExceptUS)
  • BANERJEE, Nilanjana [US/US]; NL (UsOnly)
  • DIMITROVA, Nevenka [US/US]; NL (UsOnly)
  • LUCITO, Robert [US/US]; NL (UsOnly)
Inventeurs
  • BANERJEE, Nilanjana; NL
  • DIMITROVA, Nevenka; NL
  • LUCITO, Robert; NL
Mandataires
  • VAN VELZEN, Maaike; c/o High Tech Campus Building 44 NL-5656 AE Eindhoven, NL
Données relatives à la priorité
61/359,39929.06.2010US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) PATHWAY ANALYSIS FOR PROVIDING PREDICTIVE INFORMATION
(FR) ANALYSE DE VOIES POUR FOURNIR DES INFORMATIONS PRÉDICTIVES
Abrégé
(EN)
A method for assigning ranking scores to pathways in a set of pathways for classifying patients is disclosed. The method comprises the steps of comparing biomolecular datasets from different groups of patients and performing an analysis in order to assign ranking scores to pathways in a set of pathways. Furthermore, a method for using cancer pathway evaluation to support clinical decision making is disclosed. This assessment is further used for stratifying ovarian cancer patients based on chemosensitivity to platinum based drugs, the standard chemotherapy. We present the method for evaluation and ranking of the most relevant pathways responsible for platinum sensitivity. Clinical decision support software system should be able to then visualize this information for a clinician, contextualize it within a patient data set and help make a final decision on the potential responsiveness.
(FR)
La présente invention concerne un procédé permettant d'attribuer des scores de classement à des voies dans un ensemble de voies pour classer des patients. Le procédé comprend les étapes consistant à comparer des ensembles de données biomoléculaires issus de différents groupes de patients et à effectuer une analyse afin d'attribuer des scores de classement aux voies dans un ensemble de voies. En outre, l'invention concerne un procédé permettant d'utiliser un procédé permettant d'utiliser l'évaluation des voies de développement du cancer pour soutenir une prise de décision clinique. Cette évaluation est en outre utilisée pour stratifier les patientes atteintes de cancer ovarien sur la base de leur chimiosensibilité aux médicaments à base de platine, la chimiothérapie standard. Nous présentons le procédé d'évaluation et de classement des voies les plus pertinentes responsables de la sensibilité au platine. Un logiciel de soutien à la décision clinique devrait alors pouvoir visualiser ces informations pour le clinicien, les contextualiser au sein d'un ensemble de données patients et permettre de prendre une décision finale sur la sensibilité potentielle.
Également publié en tant que
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