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1. WO2011060557 - PROCÉDÉ DE SÉLECTION D'APTAMÈRES

Numéro de publication WO/2011/060557
Date de publication 26.05.2011
N° de la demande internationale PCT/CA2010/001887
Date du dépôt international 22.11.2010
CIB
C12Q 1/68 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
C40B 30/04 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
40TECHNOLOGIE COMBINATOIRE
BCHIMIE COMBINATOIRE; BIBLIOTHÈQUES, p.ex. CHIMIOTHÈQUES, BIBLIOTHÈQUES VIRTUELLES (IN SILICO)
30Procédés de criblage des bibliothèques
04en mesurant l'aptitude spécifique à se lier à une molécule cible, p.ex. liaison anticorps-antigène, liaison récepteur-ligand
C12N 15/115 2010.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
15Techniques de mutation ou génie génétique; ADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p.ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purification; Utilisation d'hôtes pour ceux-ci
09Technologie d'ADN recombinant
11Fragments d'ADN ou d'ARN; Leurs formes modifiées
115Aptamères, c. à d. acides nucléiques liant spécifiquement une molécule cible avec une haute affinité sans s'y hybrider
CPC
C12N 15/115
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
15Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
09Recombinant DNA-technology
11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof
115Aptamers, i.e. nucleic acids binding a target molecule specifically and with high affinity without hybridising therewith ; ; Nucleic acids binding to non-nucleic acids, e.g. aptamers
C12N 2310/16
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
2310Structure or type of the nucleic acid
10Type of nucleic acid
16Aptamers
C12N 2330/31
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
2330Production
30chemically synthesised
31Libraries, arrays
C12Q 1/6811
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6811Selection methods for production or design of target specific oligonucleotides or binding molecules
C12Q 2600/136
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
2600Oligonucleotides characterized by their use
136Screening for pharmacological compounds
G01N 33/5308
GPHYSICS
01MEASURING; TESTING
NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
33Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
48Biological material, e.g. blood, urine
50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
5308for analytes not provided for elsewhere, e.g. nucleic acids, uric acid, worms, mites
Déposants
  • GOVERNORS OF THE UNIVERSITY OF ALBERTA [CA]/[CA] (AllExceptUS)
  • LI, Xing-Fang [CA]/[CA] (UsOnly)
  • ZHANG, Jing [CN]/[CA] (UsOnly)
  • LIU, Yanming [CN]/[CA] (UsOnly)
  • LE, X. Chris [CN]/[CA] (UsOnly)
Inventeurs
  • LI, Xing-Fang
  • ZHANG, Jing
  • LIU, Yanming
  • LE, X. Chris
Mandataires
  • BENNETT JONES LLP
Données relatives à la priorité
61/263,05320.11.2009US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) METHOD FOR SELECTION OF APTAMERS
(FR) PROCÉDÉ DE SÉLECTION D'APTAMÈRES
Abrégé
(EN)
A method of selecting aptamers which specifically bind to target molecules is provided in which the target molecules are separated by gel electrophoresis and transferred onto a membrane. The membrane is incubated with a randomized mixture of aptamers, particularly single stranded DNA, under conditions to form aptamer-target molecule complexes on the membrane. The membrane is washed or contacted with DNAse I to remove unbound aptamers and weakly bound aptamers. The bound aptamers are eluted from the aptamer-target molecule complexes, amplified and sequenced.
(FR)
L'invention concerne un procédé de sélection d'aptamères se liant spécifiquement à des molécules cibles. Le procédé comprend : la séparation des molécules cibles par électrophorèse sur gel et leur transfert sur une membrane ; l'incubation de la membrane avec un mélange randomisé d'aptamères, en particulier des ADN monocaténaires, dans des conditions permettant de former des complexes aptamère-molécule cible sur la membrane ; le lavage de la membrane ou sa mise en contact avec l'ADNase I pour éliminer les aptamères non liés et les aptamères faiblement liés ; puis l'élution des aptamères liés à partir des complexes aptamère-molécule cible, et l'amplification et le séquençage des aptamères élués.
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